Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1U0

ZNRD1, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA12, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRD1Q9P1U0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNRD1Q9P1U0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNRD1Q9P1U0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNRD1Q9P1U0 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNRD1Q9P1U0 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNRD1Q9P1U0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNRD1Q9P1U0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNRD1Q9P1U0 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNRD1Q9P1U0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNRD1Q9P1U0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNRD1Q9P1U0 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNRD1Q9P1U0 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNRD1Q9P1U0 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNRD1Q9P1U0 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNRD1Q9P1U0 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNRD1Q9P1U0 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNRD1Q9P1U0 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNRD1Q9P1U0 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNRD1Q9P1U0 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNRD1Q9P1U0 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNRD1Q9P1U0 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNRD1Q9P1U0 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNRD1Q9P1U0 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNRD1Q9P1U0 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNRD1Q9P1U0 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNRD1Q9P1U0 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNRD1Q9P1U0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNRD1Q9P1U0 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNRD1Q9P1U0 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNRD1Q9P1U0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNRD1Q9P1U0 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNRD1Q9P1U0 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNRD1Q9P1U0 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNRD1Q9P1U0 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNRD1Q9P1U0 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNRD1Q9P1U0 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNRD1Q9P1U0 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNRD1Q9P1U0 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNRD1Q9P1U0 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNRD1Q9P1U0 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNRD1Q9P1U0 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNRD1Q9P1U0 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNRD1Q9P1U0 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNRD1Q9P1U0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNRD1Q9P1U0 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNRD1Q9P1U0 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNRD1Q9P1U0 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNRD1Q9P1U0 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNRD1Q9P1U0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNRD1Q9P1U0 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNRD1Q9P1U0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNRD1Q9P1U0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNRD1Q9P1U0 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNRD1Q9P1U0 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNRD1Q9P1U0 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNRD1Q9P1U0 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNRD1Q9P1U0 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNRD1Q9P1U0 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNRD1Q9P1U0 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNRD1Q9P1U0 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNRD1Q9P1U0 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNRD1Q9P1U0 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNRD1Q9P1U0 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNRD1Q9P1U0 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNRD1Q9P1U0 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNRD1Q9P1U0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNRD1Q9P1U0 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNRD1Q9P1U0 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNRD1Q9P1U0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNRD1Q9P1U0 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNRD1Q9P1U0 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNRD1Q9P1U0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNRD1Q9P1U0 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNRD1Q9P1U0 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNRD1Q9P1U0 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNRD1Q9P1U0 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNRD1Q9P1U0 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNRD1Q9P1U0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNRD1Q9P1U0 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNRD1Q9P1U0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNRD1Q9P1U0 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNRD1Q9P1U0 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNRD1Q9P1U0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNRD1Q9P1U0 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNRD1Q9P1U0 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNRD1Q9P1U0 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNRD1Q9P1U0 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNRD1Q9P1U0 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNRD1Q9P1U0 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNRD1Q9P1U0 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNRD1Q9P1U0 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNRD1Q9P1U0 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNRD1Q9P1U0 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNRD1Q9P1U0 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNRD1Q9P1U0 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNRD1Q9P1U0 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNRD1Q9P1U0 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNRD1Q9P1U0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNRD1Q9P1U0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNRD1Q9P1U0 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms