Protein–RNA interactions for Protein: Q9P031

CCDC59, Thyroid transcription factor 1-associated protein 26, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC59Q9P031 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC59Q9P031 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC59Q9P031 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC59Q9P031 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC59Q9P031 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC59Q9P031 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC59Q9P031 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC59Q9P031 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC59Q9P031 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC59Q9P031 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC59Q9P031 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC59Q9P031 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC59Q9P031 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC59Q9P031 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC59Q9P031 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC59Q9P031 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC59Q9P031 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC59Q9P031 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC59Q9P031 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC59Q9P031 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC59Q9P031 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC59Q9P031 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC59Q9P031 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC59Q9P031 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC59Q9P031 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC59Q9P031 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC59Q9P031 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC59Q9P031 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC59Q9P031 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC59Q9P031 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC59Q9P031 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC59Q9P031 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC59Q9P031 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC59Q9P031 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC59Q9P031 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC59Q9P031 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC59Q9P031 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC59Q9P031 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC59Q9P031 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC59Q9P031 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC59Q9P031 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC59Q9P031 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC59Q9P031 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC59Q9P031 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC59Q9P031 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC59Q9P031 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC59Q9P031 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC59Q9P031 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC59Q9P031 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC59Q9P031 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC59Q9P031 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC59Q9P031 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC59Q9P031 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC59Q9P031 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC59Q9P031 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC59Q9P031 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC59Q9P031 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC59Q9P031 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC59Q9P031 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC59Q9P031 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC59Q9P031 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC59Q9P031 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC59Q9P031 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC59Q9P031 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC59Q9P031 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC59Q9P031 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC59Q9P031 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC59Q9P031 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC59Q9P031 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC59Q9P031 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC59Q9P031 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC59Q9P031 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC59Q9P031 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC59Q9P031 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC59Q9P031 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC59Q9P031 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC59Q9P031 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC59Q9P031 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC59Q9P031 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC59Q9P031 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC59Q9P031 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC59Q9P031 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC59Q9P031 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC59Q9P031 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC59Q9P031 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC59Q9P031 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC59Q9P031 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC59Q9P031 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC59Q9P031 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC59Q9P031 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC59Q9P031 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC59Q9P031 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC59Q9P031 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC59Q9P031 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC59Q9P031 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC59Q9P031 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC59Q9P031 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC59Q9P031 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC59Q9P031 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC59Q9P031 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms