Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZU5

LMCD1, LIM and cysteine-rich domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMCD1Q9NZU5 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMCD1Q9NZU5 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMCD1Q9NZU5 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMCD1Q9NZU5 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LMCD1Q9NZU5 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LMCD1Q9NZU5 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMCD1Q9NZU5 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMCD1Q9NZU5 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMCD1Q9NZU5 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMCD1Q9NZU5 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LMCD1Q9NZU5 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMCD1Q9NZU5 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMCD1Q9NZU5 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LMCD1Q9NZU5 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMCD1Q9NZU5 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
LMCD1Q9NZU5 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMCD1Q9NZU5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMCD1Q9NZU5 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMCD1Q9NZU5 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMCD1Q9NZU5 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMCD1Q9NZU5 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMCD1Q9NZU5 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMCD1Q9NZU5 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMCD1Q9NZU5 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMCD1Q9NZU5 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LMCD1Q9NZU5 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMCD1Q9NZU5 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMCD1Q9NZU5 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMCD1Q9NZU5 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMCD1Q9NZU5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMCD1Q9NZU5 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMCD1Q9NZU5 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMCD1Q9NZU5 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMCD1Q9NZU5 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMCD1Q9NZU5 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMCD1Q9NZU5 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMCD1Q9NZU5 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LMCD1Q9NZU5 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LMCD1Q9NZU5 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LMCD1Q9NZU5 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMCD1Q9NZU5 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMCD1Q9NZU5 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMCD1Q9NZU5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMCD1Q9NZU5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMCD1Q9NZU5 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMCD1Q9NZU5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMCD1Q9NZU5 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMCD1Q9NZU5 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMCD1Q9NZU5 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMCD1Q9NZU5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMCD1Q9NZU5 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LMCD1Q9NZU5 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMCD1Q9NZU5 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMCD1Q9NZU5 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMCD1Q9NZU5 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMCD1Q9NZU5 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMCD1Q9NZU5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMCD1Q9NZU5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMCD1Q9NZU5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMCD1Q9NZU5 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMCD1Q9NZU5 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMCD1Q9NZU5 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMCD1Q9NZU5 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMCD1Q9NZU5 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMCD1Q9NZU5 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMCD1Q9NZU5 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMCD1Q9NZU5 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMCD1Q9NZU5 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LMCD1Q9NZU5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMCD1Q9NZU5 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMCD1Q9NZU5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMCD1Q9NZU5 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMCD1Q9NZU5 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMCD1Q9NZU5 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMCD1Q9NZU5 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LMCD1Q9NZU5 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMCD1Q9NZU5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMCD1Q9NZU5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMCD1Q9NZU5 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMCD1Q9NZU5 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMCD1Q9NZU5 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMCD1Q9NZU5 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMCD1Q9NZU5 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMCD1Q9NZU5 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMCD1Q9NZU5 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMCD1Q9NZU5 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMCD1Q9NZU5 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMCD1Q9NZU5 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMCD1Q9NZU5 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMCD1Q9NZU5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMCD1Q9NZU5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMCD1Q9NZU5 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
LMCD1Q9NZU5 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMCD1Q9NZU5 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMCD1Q9NZU5 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMCD1Q9NZU5 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LMCD1Q9NZU5 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMCD1Q9NZU5 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMCD1Q9NZU5 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMCD1Q9NZU5 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms