Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RDH8Q9NYR8 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RDH8Q9NYR8 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms