Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWK9

ZNHIT6, Box C/D snoRNA protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT6Q9NWK9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNHIT6Q9NWK9 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNHIT6Q9NWK9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNHIT6Q9NWK9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNHIT6Q9NWK9 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNHIT6Q9NWK9 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNHIT6Q9NWK9 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNHIT6Q9NWK9 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNHIT6Q9NWK9 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNHIT6Q9NWK9 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNHIT6Q9NWK9 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNHIT6Q9NWK9 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNHIT6Q9NWK9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNHIT6Q9NWK9 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNHIT6Q9NWK9 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNHIT6Q9NWK9 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNHIT6Q9NWK9 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNHIT6Q9NWK9 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNHIT6Q9NWK9 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNHIT6Q9NWK9 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNHIT6Q9NWK9 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNHIT6Q9NWK9 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNHIT6Q9NWK9 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNHIT6Q9NWK9 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNHIT6Q9NWK9 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNHIT6Q9NWK9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNHIT6Q9NWK9 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNHIT6Q9NWK9 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNHIT6Q9NWK9 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNHIT6Q9NWK9 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNHIT6Q9NWK9 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNHIT6Q9NWK9 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNHIT6Q9NWK9 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNHIT6Q9NWK9 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNHIT6Q9NWK9 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNHIT6Q9NWK9 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNHIT6Q9NWK9 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNHIT6Q9NWK9 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNHIT6Q9NWK9 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNHIT6Q9NWK9 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNHIT6Q9NWK9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNHIT6Q9NWK9 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNHIT6Q9NWK9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNHIT6Q9NWK9 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNHIT6Q9NWK9 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNHIT6Q9NWK9 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNHIT6Q9NWK9 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNHIT6Q9NWK9 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNHIT6Q9NWK9 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNHIT6Q9NWK9 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNHIT6Q9NWK9 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNHIT6Q9NWK9 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNHIT6Q9NWK9 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNHIT6Q9NWK9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNHIT6Q9NWK9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNHIT6Q9NWK9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNHIT6Q9NWK9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNHIT6Q9NWK9 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNHIT6Q9NWK9 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNHIT6Q9NWK9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNHIT6Q9NWK9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNHIT6Q9NWK9 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNHIT6Q9NWK9 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNHIT6Q9NWK9 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNHIT6Q9NWK9 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNHIT6Q9NWK9 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNHIT6Q9NWK9 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNHIT6Q9NWK9 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNHIT6Q9NWK9 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
ZNHIT6Q9NWK9 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNHIT6Q9NWK9 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNHIT6Q9NWK9 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNHIT6Q9NWK9 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNHIT6Q9NWK9 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNHIT6Q9NWK9 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNHIT6Q9NWK9 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNHIT6Q9NWK9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNHIT6Q9NWK9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNHIT6Q9NWK9 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNHIT6Q9NWK9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNHIT6Q9NWK9 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNHIT6Q9NWK9 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNHIT6Q9NWK9 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNHIT6Q9NWK9 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNHIT6Q9NWK9 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNHIT6Q9NWK9 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNHIT6Q9NWK9 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNHIT6Q9NWK9 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNHIT6Q9NWK9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNHIT6Q9NWK9 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNHIT6Q9NWK9 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNHIT6Q9NWK9 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNHIT6Q9NWK9 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNHIT6Q9NWK9 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNHIT6Q9NWK9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNHIT6Q9NWK9 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNHIT6Q9NWK9 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNHIT6Q9NWK9 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNHIT6Q9NWK9 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNHIT6Q9NWK9 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms