Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUV7

SPTLC3, Serine palmitoyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC3Q9NUV7 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPTLC3Q9NUV7 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPTLC3Q9NUV7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPTLC3Q9NUV7 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPTLC3Q9NUV7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPTLC3Q9NUV7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPTLC3Q9NUV7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPTLC3Q9NUV7 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPTLC3Q9NUV7 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPTLC3Q9NUV7 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPTLC3Q9NUV7 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPTLC3Q9NUV7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SPTLC3Q9NUV7 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPTLC3Q9NUV7 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPTLC3Q9NUV7 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPTLC3Q9NUV7 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPTLC3Q9NUV7 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPTLC3Q9NUV7 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPTLC3Q9NUV7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPTLC3Q9NUV7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPTLC3Q9NUV7 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPTLC3Q9NUV7 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SPTLC3Q9NUV7 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPTLC3Q9NUV7 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPTLC3Q9NUV7 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPTLC3Q9NUV7 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SPTLC3Q9NUV7 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPTLC3Q9NUV7 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPTLC3Q9NUV7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPTLC3Q9NUV7 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPTLC3Q9NUV7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPTLC3Q9NUV7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPTLC3Q9NUV7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPTLC3Q9NUV7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPTLC3Q9NUV7 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPTLC3Q9NUV7 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPTLC3Q9NUV7 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPTLC3Q9NUV7 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SPTLC3Q9NUV7 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPTLC3Q9NUV7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPTLC3Q9NUV7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPTLC3Q9NUV7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPTLC3Q9NUV7 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPTLC3Q9NUV7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPTLC3Q9NUV7 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SPTLC3Q9NUV7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SPTLC3Q9NUV7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SPTLC3Q9NUV7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPTLC3Q9NUV7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SPTLC3Q9NUV7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SPTLC3Q9NUV7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SPTLC3Q9NUV7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SPTLC3Q9NUV7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SPTLC3Q9NUV7 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPTLC3Q9NUV7 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPTLC3Q9NUV7 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPTLC3Q9NUV7 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPTLC3Q9NUV7 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPTLC3Q9NUV7 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPTLC3Q9NUV7 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPTLC3Q9NUV7 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPTLC3Q9NUV7 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPTLC3Q9NUV7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPTLC3Q9NUV7 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPTLC3Q9NUV7 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPTLC3Q9NUV7 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPTLC3Q9NUV7 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPTLC3Q9NUV7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPTLC3Q9NUV7 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPTLC3Q9NUV7 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPTLC3Q9NUV7 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPTLC3Q9NUV7 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPTLC3Q9NUV7 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPTLC3Q9NUV7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPTLC3Q9NUV7 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPTLC3Q9NUV7 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPTLC3Q9NUV7 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPTLC3Q9NUV7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPTLC3Q9NUV7 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPTLC3Q9NUV7 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPTLC3Q9NUV7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPTLC3Q9NUV7 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPTLC3Q9NUV7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPTLC3Q9NUV7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPTLC3Q9NUV7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPTLC3Q9NUV7 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPTLC3Q9NUV7 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPTLC3Q9NUV7 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPTLC3Q9NUV7 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPTLC3Q9NUV7 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPTLC3Q9NUV7 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPTLC3Q9NUV7 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPTLC3Q9NUV7 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPTLC3Q9NUV7 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPTLC3Q9NUV7 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPTLC3Q9NUV7 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPTLC3Q9NUV7 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPTLC3Q9NUV7 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPTLC3Q9NUV7 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPTLC3Q9NUV7 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms