Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUS5

AP5S1, AP-5 complex subunit sigma-1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5S1Q9NUS5 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP5S1Q9NUS5 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AP5S1Q9NUS5 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms