Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTQ9

GJB4, Gap junction beta-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB4Q9NTQ9 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJB4Q9NTQ9 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GJB4Q9NTQ9 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJB4Q9NTQ9 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJB4Q9NTQ9 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJB4Q9NTQ9 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJB4Q9NTQ9 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GJB4Q9NTQ9 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJB4Q9NTQ9 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJB4Q9NTQ9 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJB4Q9NTQ9 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJB4Q9NTQ9 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJB4Q9NTQ9 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GJB4Q9NTQ9 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GJB4Q9NTQ9 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJB4Q9NTQ9 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJB4Q9NTQ9 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GJB4Q9NTQ9 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GJB4Q9NTQ9 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GJB4Q9NTQ9 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GJB4Q9NTQ9 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GJB4Q9NTQ9 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
GJB4Q9NTQ9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJB4Q9NTQ9 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJB4Q9NTQ9 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJB4Q9NTQ9 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJB4Q9NTQ9 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJB4Q9NTQ9 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJB4Q9NTQ9 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GJB4Q9NTQ9 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GJB4Q9NTQ9 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GJB4Q9NTQ9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GJB4Q9NTQ9 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GJB4Q9NTQ9 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GJB4Q9NTQ9 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GJB4Q9NTQ9 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GJB4Q9NTQ9 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GJB4Q9NTQ9 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GJB4Q9NTQ9 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GJB4Q9NTQ9 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GJB4Q9NTQ9 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GJB4Q9NTQ9 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GJB4Q9NTQ9 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GJB4Q9NTQ9 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GJB4Q9NTQ9 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GJB4Q9NTQ9 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GJB4Q9NTQ9 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GJB4Q9NTQ9 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJB4Q9NTQ9 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJB4Q9NTQ9 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJB4Q9NTQ9 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJB4Q9NTQ9 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJB4Q9NTQ9 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJB4Q9NTQ9 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJB4Q9NTQ9 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GJB4Q9NTQ9 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GJB4Q9NTQ9 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GJB4Q9NTQ9 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJB4Q9NTQ9 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJB4Q9NTQ9 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJB4Q9NTQ9 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJB4Q9NTQ9 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJB4Q9NTQ9 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJB4Q9NTQ9 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJB4Q9NTQ9 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJB4Q9NTQ9 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJB4Q9NTQ9 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJB4Q9NTQ9 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJB4Q9NTQ9 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJB4Q9NTQ9 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJB4Q9NTQ9 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJB4Q9NTQ9 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GJB4Q9NTQ9 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJB4Q9NTQ9 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GJB4Q9NTQ9 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJB4Q9NTQ9 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GJB4Q9NTQ9 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJB4Q9NTQ9 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJB4Q9NTQ9 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJB4Q9NTQ9 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJB4Q9NTQ9 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJB4Q9NTQ9 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJB4Q9NTQ9 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GJB4Q9NTQ9 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GJB4Q9NTQ9 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GJB4Q9NTQ9 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GJB4Q9NTQ9 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GJB4Q9NTQ9 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GJB4Q9NTQ9 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GJB4Q9NTQ9 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GJB4Q9NTQ9 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GJB4Q9NTQ9 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GJB4Q9NTQ9 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GJB4Q9NTQ9 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GJB4Q9NTQ9 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GJB4Q9NTQ9 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GJB4Q9NTQ9 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GJB4Q9NTQ9 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GJB4Q9NTQ9 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GJB4Q9NTQ9 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms