Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ3

CCL28, C-C motif chemokine 28, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL28Q9NRJ3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCL28Q9NRJ3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCL28Q9NRJ3 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms