Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR96

TLR9, Toll-like receptor 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR9Q9NR96 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TLR9Q9NR96 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TLR9Q9NR96 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TLR9Q9NR96 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TLR9Q9NR96 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TLR9Q9NR96 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TLR9Q9NR96 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TLR9Q9NR96 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TLR9Q9NR96 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TLR9Q9NR96 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TLR9Q9NR96 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TLR9Q9NR96 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TLR9Q9NR96 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TLR9Q9NR96 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TLR9Q9NR96 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TLR9Q9NR96 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TLR9Q9NR96 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TLR9Q9NR96 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TLR9Q9NR96 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TLR9Q9NR96 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TLR9Q9NR96 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TLR9Q9NR96 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TLR9Q9NR96 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TLR9Q9NR96 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TLR9Q9NR96 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TLR9Q9NR96 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TLR9Q9NR96 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TLR9Q9NR96 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TLR9Q9NR96 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TLR9Q9NR96 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TLR9Q9NR96 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TLR9Q9NR96 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TLR9Q9NR96 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TLR9Q9NR96 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TLR9Q9NR96 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TLR9Q9NR96 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TLR9Q9NR96 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TLR9Q9NR96 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TLR9Q9NR96 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TLR9Q9NR96 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TLR9Q9NR96 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TLR9Q9NR96 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TLR9Q9NR96 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TLR9Q9NR96 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TLR9Q9NR96 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TLR9Q9NR96 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TLR9Q9NR96 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TLR9Q9NR96 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TLR9Q9NR96 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TLR9Q9NR96 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TLR9Q9NR96 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TLR9Q9NR96 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TLR9Q9NR96 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TLR9Q9NR96 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TLR9Q9NR96 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TLR9Q9NR96 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TLR9Q9NR96 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TLR9Q9NR96 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TLR9Q9NR96 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TLR9Q9NR96 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TLR9Q9NR96 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TLR9Q9NR96 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TLR9Q9NR96 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TLR9Q9NR96 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TLR9Q9NR96 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TLR9Q9NR96 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TLR9Q9NR96 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TLR9Q9NR96 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TLR9Q9NR96 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TLR9Q9NR96 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TLR9Q9NR96 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TLR9Q9NR96 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TLR9Q9NR96 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TLR9Q9NR96 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TLR9Q9NR96 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TLR9Q9NR96 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TLR9Q9NR96 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TLR9Q9NR96 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TLR9Q9NR96 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TLR9Q9NR96 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TLR9Q9NR96 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TLR9Q9NR96 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TLR9Q9NR96 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TLR9Q9NR96 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TLR9Q9NR96 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TLR9Q9NR96 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TLR9Q9NR96 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TLR9Q9NR96 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TLR9Q9NR96 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TLR9Q9NR96 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TLR9Q9NR96 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TLR9Q9NR96 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TLR9Q9NR96 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TLR9Q9NR96 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TLR9Q9NR96 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TLR9Q9NR96 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TLR9Q9NR96 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TLR9Q9NR96 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TLR9Q9NR96 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TLR9Q9NR96 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms