Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR80

ARHGEF4, Rho guanine nucleotide exchange factor 4, humanhuman

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Length 690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF4Q9NR80 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGEF4Q9NR80 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGEF4Q9NR80 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGEF4Q9NR80 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGEF4Q9NR80 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGEF4Q9NR80 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGEF4Q9NR80 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGEF4Q9NR80 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGEF4Q9NR80 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGEF4Q9NR80 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGEF4Q9NR80 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARHGEF4Q9NR80 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARHGEF4Q9NR80 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARHGEF4Q9NR80 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARHGEF4Q9NR80 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARHGEF4Q9NR80 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARHGEF4Q9NR80 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARHGEF4Q9NR80 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARHGEF4Q9NR80 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARHGEF4Q9NR80 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ARHGEF4Q9NR80 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARHGEF4Q9NR80 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARHGEF4Q9NR80 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARHGEF4Q9NR80 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARHGEF4Q9NR80 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARHGEF4Q9NR80 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARHGEF4Q9NR80 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ARHGEF4Q9NR80 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARHGEF4Q9NR80 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARHGEF4Q9NR80 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARHGEF4Q9NR80 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARHGEF4Q9NR80 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARHGEF4Q9NR80 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARHGEF4Q9NR80 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARHGEF4Q9NR80 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ARHGEF4Q9NR80 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARHGEF4Q9NR80 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARHGEF4Q9NR80 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARHGEF4Q9NR80 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARHGEF4Q9NR80 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARHGEF4Q9NR80 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARHGEF4Q9NR80 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARHGEF4Q9NR80 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARHGEF4Q9NR80 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARHGEF4Q9NR80 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARHGEF4Q9NR80 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARHGEF4Q9NR80 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARHGEF4Q9NR80 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARHGEF4Q9NR80 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ARHGEF4Q9NR80 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ARHGEF4Q9NR80 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARHGEF4Q9NR80 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARHGEF4Q9NR80 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARHGEF4Q9NR80 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARHGEF4Q9NR80 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARHGEF4Q9NR80 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARHGEF4Q9NR80 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARHGEF4Q9NR80 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARHGEF4Q9NR80 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARHGEF4Q9NR80 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARHGEF4Q9NR80 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARHGEF4Q9NR80 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARHGEF4Q9NR80 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARHGEF4Q9NR80 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARHGEF4Q9NR80 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARHGEF4Q9NR80 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARHGEF4Q9NR80 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ARHGEF4Q9NR80 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARHGEF4Q9NR80 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARHGEF4Q9NR80 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ARHGEF4Q9NR80 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ARHGEF4Q9NR80 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARHGEF4Q9NR80 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARHGEF4Q9NR80 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ARHGEF4Q9NR80 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARHGEF4Q9NR80 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ARHGEF4Q9NR80 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ARHGEF4Q9NR80 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARHGEF4Q9NR80 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
ARHGEF4Q9NR80 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ARHGEF4Q9NR80 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARHGEF4Q9NR80 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARHGEF4Q9NR80 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ARHGEF4Q9NR80 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARHGEF4Q9NR80 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARHGEF4Q9NR80 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARHGEF4Q9NR80 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARHGEF4Q9NR80 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARHGEF4Q9NR80 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARHGEF4Q9NR80 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ARHGEF4Q9NR80 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARHGEF4Q9NR80 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARHGEF4Q9NR80 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARHGEF4Q9NR80 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARHGEF4Q9NR80 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARHGEF4Q9NR80 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARHGEF4Q9NR80 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARHGEF4Q9NR80 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARHGEF4Q9NR80 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARHGEF4Q9NR80 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
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