Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQS7

INCENP, Inner centromere protein, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INCENPQ9NQS7 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
INCENPQ9NQS7 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
INCENPQ9NQS7 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
INCENPQ9NQS7 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
INCENPQ9NQS7 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
INCENPQ9NQS7 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
INCENPQ9NQS7 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
INCENPQ9NQS7 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
INCENPQ9NQS7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
INCENPQ9NQS7 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
INCENPQ9NQS7 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
INCENPQ9NQS7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
INCENPQ9NQS7 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
INCENPQ9NQS7 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
INCENPQ9NQS7 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
INCENPQ9NQS7 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
INCENPQ9NQS7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
INCENPQ9NQS7 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
INCENPQ9NQS7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
INCENPQ9NQS7 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
INCENPQ9NQS7 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
INCENPQ9NQS7 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
INCENPQ9NQS7 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
INCENPQ9NQS7 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
INCENPQ9NQS7 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
INCENPQ9NQS7 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
INCENPQ9NQS7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
INCENPQ9NQS7 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
INCENPQ9NQS7 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
INCENPQ9NQS7 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
INCENPQ9NQS7 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
INCENPQ9NQS7 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
INCENPQ9NQS7 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
INCENPQ9NQS7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
INCENPQ9NQS7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
INCENPQ9NQS7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
INCENPQ9NQS7 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
INCENPQ9NQS7 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
INCENPQ9NQS7 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
INCENPQ9NQS7 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
INCENPQ9NQS7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
INCENPQ9NQS7 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
INCENPQ9NQS7 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
INCENPQ9NQS7 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
INCENPQ9NQS7 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
INCENPQ9NQS7 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
INCENPQ9NQS7 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
INCENPQ9NQS7 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
INCENPQ9NQS7 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
INCENPQ9NQS7 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
INCENPQ9NQS7 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
INCENPQ9NQS7 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
INCENPQ9NQS7 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
INCENPQ9NQS7 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
INCENPQ9NQS7 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
INCENPQ9NQS7 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
INCENPQ9NQS7 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
INCENPQ9NQS7 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
INCENPQ9NQS7 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
INCENPQ9NQS7 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
INCENPQ9NQS7 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
INCENPQ9NQS7 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
INCENPQ9NQS7 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
INCENPQ9NQS7 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
INCENPQ9NQS7 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
INCENPQ9NQS7 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
INCENPQ9NQS7 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
INCENPQ9NQS7 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
INCENPQ9NQS7 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
INCENPQ9NQS7 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
INCENPQ9NQS7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
INCENPQ9NQS7 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
INCENPQ9NQS7 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
INCENPQ9NQS7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
INCENPQ9NQS7 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
INCENPQ9NQS7 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
INCENPQ9NQS7 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
INCENPQ9NQS7 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
INCENPQ9NQS7 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
INCENPQ9NQS7 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
INCENPQ9NQS7 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
INCENPQ9NQS7 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
INCENPQ9NQS7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
INCENPQ9NQS7 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
INCENPQ9NQS7 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
INCENPQ9NQS7 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
INCENPQ9NQS7 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
INCENPQ9NQS7 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
INCENPQ9NQS7 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
INCENPQ9NQS7 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
INCENPQ9NQS7 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
INCENPQ9NQS7 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
INCENPQ9NQS7 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
INCENPQ9NQS7 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
INCENPQ9NQS7 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
INCENPQ9NQS7 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
INCENPQ9NQS7 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
INCENPQ9NQS7 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
INCENPQ9NQS7 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
INCENPQ9NQS7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms