Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG3

UBN1, Ubinuclein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBN1Q9NPG3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBN1Q9NPG3 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBN1Q9NPG3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBN1Q9NPG3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBN1Q9NPG3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBN1Q9NPG3 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBN1Q9NPG3 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBN1Q9NPG3 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBN1Q9NPG3 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBN1Q9NPG3 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBN1Q9NPG3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBN1Q9NPG3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBN1Q9NPG3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
UBN1Q9NPG3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
UBN1Q9NPG3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
UBN1Q9NPG3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
UBN1Q9NPG3 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBN1Q9NPG3 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBN1Q9NPG3 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBN1Q9NPG3 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBN1Q9NPG3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBN1Q9NPG3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBN1Q9NPG3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBN1Q9NPG3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBN1Q9NPG3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBN1Q9NPG3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBN1Q9NPG3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBN1Q9NPG3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBN1Q9NPG3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBN1Q9NPG3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBN1Q9NPG3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBN1Q9NPG3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBN1Q9NPG3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBN1Q9NPG3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBN1Q9NPG3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBN1Q9NPG3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBN1Q9NPG3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
UBN1Q9NPG3 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
UBN1Q9NPG3 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBN1Q9NPG3 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBN1Q9NPG3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBN1Q9NPG3 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBN1Q9NPG3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBN1Q9NPG3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBN1Q9NPG3 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
UBN1Q9NPG3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBN1Q9NPG3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBN1Q9NPG3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBN1Q9NPG3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBN1Q9NPG3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBN1Q9NPG3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBN1Q9NPG3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBN1Q9NPG3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBN1Q9NPG3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
UBN1Q9NPG3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBN1Q9NPG3 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBN1Q9NPG3 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBN1Q9NPG3 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBN1Q9NPG3 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBN1Q9NPG3 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBN1Q9NPG3 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
UBN1Q9NPG3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBN1Q9NPG3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBN1Q9NPG3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBN1Q9NPG3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBN1Q9NPG3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBN1Q9NPG3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBN1Q9NPG3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBN1Q9NPG3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBN1Q9NPG3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBN1Q9NPG3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBN1Q9NPG3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBN1Q9NPG3 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBN1Q9NPG3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBN1Q9NPG3 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBN1Q9NPG3 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBN1Q9NPG3 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBN1Q9NPG3 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBN1Q9NPG3 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBN1Q9NPG3 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBN1Q9NPG3 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBN1Q9NPG3 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBN1Q9NPG3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBN1Q9NPG3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBN1Q9NPG3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBN1Q9NPG3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBN1Q9NPG3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBN1Q9NPG3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBN1Q9NPG3 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBN1Q9NPG3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBN1Q9NPG3 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBN1Q9NPG3 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBN1Q9NPG3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBN1Q9NPG3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBN1Q9NPG3 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBN1Q9NPG3 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBN1Q9NPG3 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBN1Q9NPG3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBN1Q9NPG3 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
UBN1Q9NPG3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms