Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP56

PDE7B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7B, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7BQ9NP56 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE7BQ9NP56 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE7BQ9NP56 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE7BQ9NP56 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE7BQ9NP56 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE7BQ9NP56 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE7BQ9NP56 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE7BQ9NP56 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PDE7BQ9NP56 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE7BQ9NP56 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE7BQ9NP56 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE7BQ9NP56 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE7BQ9NP56 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE7BQ9NP56 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE7BQ9NP56 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE7BQ9NP56 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE7BQ9NP56 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE7BQ9NP56 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE7BQ9NP56 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE7BQ9NP56 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE7BQ9NP56 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE7BQ9NP56 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE7BQ9NP56 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE7BQ9NP56 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE7BQ9NP56 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE7BQ9NP56 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PDE7BQ9NP56 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE7BQ9NP56 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE7BQ9NP56 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE7BQ9NP56 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE7BQ9NP56 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE7BQ9NP56 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE7BQ9NP56 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE7BQ9NP56 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE7BQ9NP56 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE7BQ9NP56 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE7BQ9NP56 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE7BQ9NP56 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE7BQ9NP56 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE7BQ9NP56 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE7BQ9NP56 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PDE7BQ9NP56 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE7BQ9NP56 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE7BQ9NP56 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE7BQ9NP56 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE7BQ9NP56 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE7BQ9NP56 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE7BQ9NP56 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE7BQ9NP56 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE7BQ9NP56 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE7BQ9NP56 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE7BQ9NP56 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE7BQ9NP56 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE7BQ9NP56 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PDE7BQ9NP56 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE7BQ9NP56 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE7BQ9NP56 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE7BQ9NP56 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE7BQ9NP56 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE7BQ9NP56 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE7BQ9NP56 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE7BQ9NP56 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE7BQ9NP56 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE7BQ9NP56 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE7BQ9NP56 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE7BQ9NP56 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE7BQ9NP56 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE7BQ9NP56 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE7BQ9NP56 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE7BQ9NP56 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PDE7BQ9NP56 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE7BQ9NP56 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE7BQ9NP56 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE7BQ9NP56 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE7BQ9NP56 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE7BQ9NP56 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE7BQ9NP56 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE7BQ9NP56 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE7BQ9NP56 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE7BQ9NP56 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE7BQ9NP56 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE7BQ9NP56 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PDE7BQ9NP56 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE7BQ9NP56 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE7BQ9NP56 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE7BQ9NP56 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE7BQ9NP56 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE7BQ9NP56 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE7BQ9NP56 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE7BQ9NP56 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE7BQ9NP56 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE7BQ9NP56 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE7BQ9NP56 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE7BQ9NP56 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE7BQ9NP56 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE7BQ9NP56 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PDE7BQ9NP56 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDE7BQ9NP56 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDE7BQ9NP56 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PDE7BQ9NP56 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms