Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNZ6

PRM3, Protamine-3, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRM3Q9NNZ6 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PRM3Q9NNZ6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PRM3Q9NNZ6 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PRM3Q9NNZ6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PRM3Q9NNZ6 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PRM3Q9NNZ6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PRM3Q9NNZ6 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PRM3Q9NNZ6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PRM3Q9NNZ6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PRM3Q9NNZ6 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PRM3Q9NNZ6 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PRM3Q9NNZ6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PRM3Q9NNZ6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PRM3Q9NNZ6 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PRM3Q9NNZ6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PRM3Q9NNZ6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PRM3Q9NNZ6 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PRM3Q9NNZ6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PRM3Q9NNZ6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PRM3Q9NNZ6 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PRM3Q9NNZ6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PRM3Q9NNZ6 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PRM3Q9NNZ6 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PRM3Q9NNZ6 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PRM3Q9NNZ6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PRM3Q9NNZ6 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PRM3Q9NNZ6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PRM3Q9NNZ6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PRM3Q9NNZ6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PRM3Q9NNZ6 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PRM3Q9NNZ6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PRM3Q9NNZ6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PRM3Q9NNZ6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PRM3Q9NNZ6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PRM3Q9NNZ6 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PRM3Q9NNZ6 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PRM3Q9NNZ6 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PRM3Q9NNZ6 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PRM3Q9NNZ6 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PRM3Q9NNZ6 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRM3Q9NNZ6 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRM3Q9NNZ6 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRM3Q9NNZ6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRM3Q9NNZ6 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRM3Q9NNZ6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRM3Q9NNZ6 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRM3Q9NNZ6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PRM3Q9NNZ6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PRM3Q9NNZ6 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRM3Q9NNZ6 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRM3Q9NNZ6 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PRM3Q9NNZ6 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRM3Q9NNZ6 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRM3Q9NNZ6 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRM3Q9NNZ6 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRM3Q9NNZ6 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRM3Q9NNZ6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRM3Q9NNZ6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PRM3Q9NNZ6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRM3Q9NNZ6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PRM3Q9NNZ6 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRM3Q9NNZ6 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRM3Q9NNZ6 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PRM3Q9NNZ6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRM3Q9NNZ6 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRM3Q9NNZ6 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRM3Q9NNZ6 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRM3Q9NNZ6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRM3Q9NNZ6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRM3Q9NNZ6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRM3Q9NNZ6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRM3Q9NNZ6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRM3Q9NNZ6 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRM3Q9NNZ6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRM3Q9NNZ6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRM3Q9NNZ6 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRM3Q9NNZ6 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRM3Q9NNZ6 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRM3Q9NNZ6 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRM3Q9NNZ6 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PRM3Q9NNZ6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRM3Q9NNZ6 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRM3Q9NNZ6 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRM3Q9NNZ6 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRM3Q9NNZ6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRM3Q9NNZ6 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRM3Q9NNZ6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRM3Q9NNZ6 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRM3Q9NNZ6 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRM3Q9NNZ6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRM3Q9NNZ6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRM3Q9NNZ6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRM3Q9NNZ6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRM3Q9NNZ6 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRM3Q9NNZ6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRM3Q9NNZ6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRM3Q9NNZ6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRM3Q9NNZ6 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRM3Q9NNZ6 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRM3Q9NNZ6 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms