Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM2

PLXNA4, Plexin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA4Q9HCM2 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PLXNA4Q9HCM2 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PLXNA4Q9HCM2 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PLXNA4Q9HCM2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PLXNA4Q9HCM2 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLXNA4Q9HCM2 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLXNA4Q9HCM2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLXNA4Q9HCM2 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLXNA4Q9HCM2 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLXNA4Q9HCM2 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLXNA4Q9HCM2 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLXNA4Q9HCM2 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLXNA4Q9HCM2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLXNA4Q9HCM2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLXNA4Q9HCM2 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLXNA4Q9HCM2 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLXNA4Q9HCM2 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLXNA4Q9HCM2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLXNA4Q9HCM2 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLXNA4Q9HCM2 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PLXNA4Q9HCM2 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLXNA4Q9HCM2 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PLXNA4Q9HCM2 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLXNA4Q9HCM2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLXNA4Q9HCM2 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLXNA4Q9HCM2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLXNA4Q9HCM2 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLXNA4Q9HCM2 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLXNA4Q9HCM2 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLXNA4Q9HCM2 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLXNA4Q9HCM2 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLXNA4Q9HCM2 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLXNA4Q9HCM2 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLXNA4Q9HCM2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLXNA4Q9HCM2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLXNA4Q9HCM2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PLXNA4Q9HCM2 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PLXNA4Q9HCM2 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PLXNA4Q9HCM2 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PLXNA4Q9HCM2 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PLXNA4Q9HCM2 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PLXNA4Q9HCM2 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PLXNA4Q9HCM2 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLXNA4Q9HCM2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLXNA4Q9HCM2 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLXNA4Q9HCM2 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PLXNA4Q9HCM2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLXNA4Q9HCM2 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PLXNA4Q9HCM2 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLXNA4Q9HCM2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLXNA4Q9HCM2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLXNA4Q9HCM2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLXNA4Q9HCM2 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLXNA4Q9HCM2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLXNA4Q9HCM2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLXNA4Q9HCM2 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLXNA4Q9HCM2 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PLXNA4Q9HCM2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLXNA4Q9HCM2 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLXNA4Q9HCM2 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLXNA4Q9HCM2 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLXNA4Q9HCM2 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLXNA4Q9HCM2 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLXNA4Q9HCM2 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PLXNA4Q9HCM2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLXNA4Q9HCM2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLXNA4Q9HCM2 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLXNA4Q9HCM2 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLXNA4Q9HCM2 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLXNA4Q9HCM2 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLXNA4Q9HCM2 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLXNA4Q9HCM2 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLXNA4Q9HCM2 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLXNA4Q9HCM2 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLXNA4Q9HCM2 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLXNA4Q9HCM2 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLXNA4Q9HCM2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLXNA4Q9HCM2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLXNA4Q9HCM2 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLXNA4Q9HCM2 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLXNA4Q9HCM2 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PLXNA4Q9HCM2 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PLXNA4Q9HCM2 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PLXNA4Q9HCM2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLXNA4Q9HCM2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLXNA4Q9HCM2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLXNA4Q9HCM2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLXNA4Q9HCM2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLXNA4Q9HCM2 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLXNA4Q9HCM2 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLXNA4Q9HCM2 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLXNA4Q9HCM2 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLXNA4Q9HCM2 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLXNA4Q9HCM2 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLXNA4Q9HCM2 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLXNA4Q9HCM2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PLXNA4Q9HCM2 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLXNA4Q9HCM2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLXNA4Q9HCM2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PLXNA4Q9HCM2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms