Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7T0

CATSPERB, Cation channel sperm-associated protein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPERBQ9H7T0 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CATSPERBQ9H7T0 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CATSPERBQ9H7T0 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CATSPERBQ9H7T0 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CATSPERBQ9H7T0 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CATSPERBQ9H7T0 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CATSPERBQ9H7T0 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CATSPERBQ9H7T0 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CATSPERBQ9H7T0 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CATSPERBQ9H7T0 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CATSPERBQ9H7T0 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CATSPERBQ9H7T0 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CATSPERBQ9H7T0 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CATSPERBQ9H7T0 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CATSPERBQ9H7T0 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CATSPERBQ9H7T0 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CATSPERBQ9H7T0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CATSPERBQ9H7T0 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CATSPERBQ9H7T0 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CATSPERBQ9H7T0 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CATSPERBQ9H7T0 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CATSPERBQ9H7T0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CATSPERBQ9H7T0 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CATSPERBQ9H7T0 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CATSPERBQ9H7T0 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CATSPERBQ9H7T0 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CATSPERBQ9H7T0 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CATSPERBQ9H7T0 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CATSPERBQ9H7T0 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CATSPERBQ9H7T0 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CATSPERBQ9H7T0 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CATSPERBQ9H7T0 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CATSPERBQ9H7T0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CATSPERBQ9H7T0 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CATSPERBQ9H7T0 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CATSPERBQ9H7T0 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CATSPERBQ9H7T0 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CATSPERBQ9H7T0 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CATSPERBQ9H7T0 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CATSPERBQ9H7T0 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CATSPERBQ9H7T0 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CATSPERBQ9H7T0 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CATSPERBQ9H7T0 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CATSPERBQ9H7T0 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CATSPERBQ9H7T0 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CATSPERBQ9H7T0 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CATSPERBQ9H7T0 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CATSPERBQ9H7T0 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CATSPERBQ9H7T0 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CATSPERBQ9H7T0 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CATSPERBQ9H7T0 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CATSPERBQ9H7T0 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CATSPERBQ9H7T0 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CATSPERBQ9H7T0 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CATSPERBQ9H7T0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CATSPERBQ9H7T0 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CATSPERBQ9H7T0 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CATSPERBQ9H7T0 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CATSPERBQ9H7T0 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CATSPERBQ9H7T0 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CATSPERBQ9H7T0 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CATSPERBQ9H7T0 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CATSPERBQ9H7T0 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CATSPERBQ9H7T0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CATSPERBQ9H7T0 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CATSPERBQ9H7T0 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CATSPERBQ9H7T0 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CATSPERBQ9H7T0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CATSPERBQ9H7T0 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CATSPERBQ9H7T0 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CATSPERBQ9H7T0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CATSPERBQ9H7T0 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CATSPERBQ9H7T0 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CATSPERBQ9H7T0 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CATSPERBQ9H7T0 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CATSPERBQ9H7T0 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CATSPERBQ9H7T0 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CATSPERBQ9H7T0 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CATSPERBQ9H7T0 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CATSPERBQ9H7T0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CATSPERBQ9H7T0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CATSPERBQ9H7T0 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CATSPERBQ9H7T0 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CATSPERBQ9H7T0 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CATSPERBQ9H7T0 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CATSPERBQ9H7T0 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CATSPERBQ9H7T0 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CATSPERBQ9H7T0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CATSPERBQ9H7T0 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CATSPERBQ9H7T0 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CATSPERBQ9H7T0 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CATSPERBQ9H7T0 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CATSPERBQ9H7T0 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CATSPERBQ9H7T0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CATSPERBQ9H7T0 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CATSPERBQ9H7T0 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CATSPERBQ9H7T0 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CATSPERBQ9H7T0 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CATSPERBQ9H7T0 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CATSPERBQ9H7T0 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms