Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2D6

TRIOBP, TRIO and F-actin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOBPQ9H2D6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIOBPQ9H2D6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIOBPQ9H2D6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIOBPQ9H2D6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIOBPQ9H2D6 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIOBPQ9H2D6 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIOBPQ9H2D6 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIOBPQ9H2D6 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIOBPQ9H2D6 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIOBPQ9H2D6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIOBPQ9H2D6 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIOBPQ9H2D6 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIOBPQ9H2D6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIOBPQ9H2D6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIOBPQ9H2D6 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIOBPQ9H2D6 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIOBPQ9H2D6 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIOBPQ9H2D6 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIOBPQ9H2D6 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIOBPQ9H2D6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIOBPQ9H2D6 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIOBPQ9H2D6 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIOBPQ9H2D6 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIOBPQ9H2D6 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIOBPQ9H2D6 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIOBPQ9H2D6 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIOBPQ9H2D6 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIOBPQ9H2D6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIOBPQ9H2D6 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIOBPQ9H2D6 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIOBPQ9H2D6 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIOBPQ9H2D6 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIOBPQ9H2D6 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIOBPQ9H2D6 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIOBPQ9H2D6 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIOBPQ9H2D6 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIOBPQ9H2D6 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIOBPQ9H2D6 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIOBPQ9H2D6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIOBPQ9H2D6 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIOBPQ9H2D6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIOBPQ9H2D6 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIOBPQ9H2D6 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIOBPQ9H2D6 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIOBPQ9H2D6 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIOBPQ9H2D6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIOBPQ9H2D6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIOBPQ9H2D6 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIOBPQ9H2D6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIOBPQ9H2D6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIOBPQ9H2D6 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIOBPQ9H2D6 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIOBPQ9H2D6 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIOBPQ9H2D6 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIOBPQ9H2D6 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIOBPQ9H2D6 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIOBPQ9H2D6 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIOBPQ9H2D6 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIOBPQ9H2D6 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIOBPQ9H2D6 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIOBPQ9H2D6 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIOBPQ9H2D6 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIOBPQ9H2D6 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIOBPQ9H2D6 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIOBPQ9H2D6 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIOBPQ9H2D6 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIOBPQ9H2D6 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIOBPQ9H2D6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIOBPQ9H2D6 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIOBPQ9H2D6 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIOBPQ9H2D6 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIOBPQ9H2D6 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIOBPQ9H2D6 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIOBPQ9H2D6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIOBPQ9H2D6 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIOBPQ9H2D6 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIOBPQ9H2D6 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIOBPQ9H2D6 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIOBPQ9H2D6 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIOBPQ9H2D6 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIOBPQ9H2D6 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIOBPQ9H2D6 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIOBPQ9H2D6 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIOBPQ9H2D6 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIOBPQ9H2D6 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIOBPQ9H2D6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIOBPQ9H2D6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIOBPQ9H2D6 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIOBPQ9H2D6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIOBPQ9H2D6 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIOBPQ9H2D6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIOBPQ9H2D6 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIOBPQ9H2D6 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIOBPQ9H2D6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIOBPQ9H2D6 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIOBPQ9H2D6 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIOBPQ9H2D6 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIOBPQ9H2D6 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIOBPQ9H2D6 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIOBPQ9H2D6 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms