Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ROPN1BQ9BZX4 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ROPN1BQ9BZX4 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ROPN1BQ9BZX4 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ROPN1BQ9BZX4 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ROPN1BQ9BZX4 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ROPN1BQ9BZX4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ROPN1BQ9BZX4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ROPN1BQ9BZX4 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ROPN1BQ9BZX4 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ROPN1BQ9BZX4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ROPN1BQ9BZX4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ROPN1BQ9BZX4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ROPN1BQ9BZX4 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ROPN1BQ9BZX4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ROPN1BQ9BZX4 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ROPN1BQ9BZX4 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ROPN1BQ9BZX4 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ROPN1BQ9BZX4 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ROPN1BQ9BZX4 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ROPN1BQ9BZX4 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ROPN1BQ9BZX4 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ROPN1BQ9BZX4 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ROPN1BQ9BZX4 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ROPN1BQ9BZX4 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ROPN1BQ9BZX4 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ROPN1BQ9BZX4 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ROPN1BQ9BZX4 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ROPN1BQ9BZX4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ROPN1BQ9BZX4 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ROPN1BQ9BZX4 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ROPN1BQ9BZX4 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ROPN1BQ9BZX4 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ROPN1BQ9BZX4 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ROPN1BQ9BZX4 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ROPN1BQ9BZX4 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ROPN1BQ9BZX4 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ROPN1BQ9BZX4 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ROPN1BQ9BZX4 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ROPN1BQ9BZX4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ROPN1BQ9BZX4 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ROPN1BQ9BZX4 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ROPN1BQ9BZX4 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ROPN1BQ9BZX4 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ROPN1BQ9BZX4 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ROPN1BQ9BZX4 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ROPN1BQ9BZX4 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ROPN1BQ9BZX4 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ROPN1BQ9BZX4 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ROPN1BQ9BZX4 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ROPN1BQ9BZX4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ROPN1BQ9BZX4 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ROPN1BQ9BZX4 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ROPN1BQ9BZX4 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ROPN1BQ9BZX4 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ROPN1BQ9BZX4 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ROPN1BQ9BZX4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ROPN1BQ9BZX4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ROPN1BQ9BZX4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ROPN1BQ9BZX4 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ROPN1BQ9BZX4 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ROPN1BQ9BZX4 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ROPN1BQ9BZX4 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ROPN1BQ9BZX4 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ROPN1BQ9BZX4 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ROPN1BQ9BZX4 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ROPN1BQ9BZX4 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ROPN1BQ9BZX4 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ROPN1BQ9BZX4 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ROPN1BQ9BZX4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ROPN1BQ9BZX4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ROPN1BQ9BZX4 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ROPN1BQ9BZX4 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ROPN1BQ9BZX4 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ROPN1BQ9BZX4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ROPN1BQ9BZX4 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ROPN1BQ9BZX4 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ROPN1BQ9BZX4 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ROPN1BQ9BZX4 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ROPN1BQ9BZX4 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ROPN1BQ9BZX4 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ROPN1BQ9BZX4 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ROPN1BQ9BZX4 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ROPN1BQ9BZX4 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ROPN1BQ9BZX4 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ROPN1BQ9BZX4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ROPN1BQ9BZX4 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ROPN1BQ9BZX4 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ROPN1BQ9BZX4 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ROPN1BQ9BZX4 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ROPN1BQ9BZX4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ROPN1BQ9BZX4 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ROPN1BQ9BZX4 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ROPN1BQ9BZX4 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ROPN1BQ9BZX4 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ROPN1BQ9BZX4 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ROPN1BQ9BZX4 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ROPN1BQ9BZX4 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ROPN1BQ9BZX4 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ROPN1BQ9BZX4 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms