Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ0

KRTAP9-8, Keratin-associated protein 9-8, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-8Q9BYQ0 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 IFNA2-201ENST00000380206 1135 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
KRTAP9-8Q9BYQ0 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms