Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY42

RTFDC1, Protein RTF2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTFDC1Q9BY42 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RTFDC1Q9BY42 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RTFDC1Q9BY42 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RTFDC1Q9BY42 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RTFDC1Q9BY42 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RTFDC1Q9BY42 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RTFDC1Q9BY42 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RTFDC1Q9BY42 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RTFDC1Q9BY42 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RTFDC1Q9BY42 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RTFDC1Q9BY42 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RTFDC1Q9BY42 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RTFDC1Q9BY42 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RTFDC1Q9BY42 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RTFDC1Q9BY42 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RTFDC1Q9BY42 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RTFDC1Q9BY42 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RTFDC1Q9BY42 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RTFDC1Q9BY42 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RTFDC1Q9BY42 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RTFDC1Q9BY42 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RTFDC1Q9BY42 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RTFDC1Q9BY42 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RTFDC1Q9BY42 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RTFDC1Q9BY42 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RTFDC1Q9BY42 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RTFDC1Q9BY42 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
RTFDC1Q9BY42 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RTFDC1Q9BY42 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RTFDC1Q9BY42 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RTFDC1Q9BY42 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RTFDC1Q9BY42 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RTFDC1Q9BY42 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RTFDC1Q9BY42 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RTFDC1Q9BY42 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RTFDC1Q9BY42 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RTFDC1Q9BY42 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RTFDC1Q9BY42 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RTFDC1Q9BY42 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RTFDC1Q9BY42 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RTFDC1Q9BY42 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RTFDC1Q9BY42 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RTFDC1Q9BY42 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RTFDC1Q9BY42 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RTFDC1Q9BY42 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RTFDC1Q9BY42 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RTFDC1Q9BY42 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RTFDC1Q9BY42 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RTFDC1Q9BY42 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RTFDC1Q9BY42 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RTFDC1Q9BY42 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RTFDC1Q9BY42 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RTFDC1Q9BY42 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RTFDC1Q9BY42 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RTFDC1Q9BY42 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RTFDC1Q9BY42 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RTFDC1Q9BY42 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
RTFDC1Q9BY42 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
RTFDC1Q9BY42 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RTFDC1Q9BY42 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
RTFDC1Q9BY42 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RTFDC1Q9BY42 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
RTFDC1Q9BY42 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RTFDC1Q9BY42 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RTFDC1Q9BY42 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RTFDC1Q9BY42 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RTFDC1Q9BY42 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RTFDC1Q9BY42 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RTFDC1Q9BY42 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RTFDC1Q9BY42 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RTFDC1Q9BY42 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RTFDC1Q9BY42 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RTFDC1Q9BY42 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RTFDC1Q9BY42 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RTFDC1Q9BY42 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RTFDC1Q9BY42 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RTFDC1Q9BY42 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RTFDC1Q9BY42 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
RTFDC1Q9BY42 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RTFDC1Q9BY42 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RTFDC1Q9BY42 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RTFDC1Q9BY42 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RTFDC1Q9BY42 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RTFDC1Q9BY42 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RTFDC1Q9BY42 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RTFDC1Q9BY42 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RTFDC1Q9BY42 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
RTFDC1Q9BY42 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RTFDC1Q9BY42 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RTFDC1Q9BY42 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RTFDC1Q9BY42 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RTFDC1Q9BY42 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RTFDC1Q9BY42 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RTFDC1Q9BY42 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RTFDC1Q9BY42 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RTFDC1Q9BY42 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RTFDC1Q9BY42 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RTFDC1Q9BY42 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RTFDC1Q9BY42 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RTFDC1Q9BY42 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms