Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SALL3Q9BXA9 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SALL3Q9BXA9 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SALL3Q9BXA9 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SALL3Q9BXA9 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SALL3Q9BXA9 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SALL3Q9BXA9 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SALL3Q9BXA9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SALL3Q9BXA9 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SALL3Q9BXA9 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SALL3Q9BXA9 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SALL3Q9BXA9 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SALL3Q9BXA9 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SALL3Q9BXA9 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SALL3Q9BXA9 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SALL3Q9BXA9 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SALL3Q9BXA9 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SALL3Q9BXA9 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SALL3Q9BXA9 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SALL3Q9BXA9 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SALL3Q9BXA9 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SALL3Q9BXA9 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SALL3Q9BXA9 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SALL3Q9BXA9 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SALL3Q9BXA9 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SALL3Q9BXA9 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SALL3Q9BXA9 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SALL3Q9BXA9 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SALL3Q9BXA9 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SALL3Q9BXA9 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SALL3Q9BXA9 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SALL3Q9BXA9 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SALL3Q9BXA9 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SALL3Q9BXA9 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SALL3Q9BXA9 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SALL3Q9BXA9 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SALL3Q9BXA9 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SALL3Q9BXA9 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SALL3Q9BXA9 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SALL3Q9BXA9 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SALL3Q9BXA9 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SALL3Q9BXA9 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SALL3Q9BXA9 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SALL3Q9BXA9 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SALL3Q9BXA9 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SALL3Q9BXA9 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SALL3Q9BXA9 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SALL3Q9BXA9 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SALL3Q9BXA9 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SALL3Q9BXA9 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SALL3Q9BXA9 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SALL3Q9BXA9 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SALL3Q9BXA9 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SALL3Q9BXA9 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SALL3Q9BXA9 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SALL3Q9BXA9 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SALL3Q9BXA9 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SALL3Q9BXA9 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SALL3Q9BXA9 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SALL3Q9BXA9 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SALL3Q9BXA9 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SALL3Q9BXA9 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SALL3Q9BXA9 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SALL3Q9BXA9 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SALL3Q9BXA9 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SALL3Q9BXA9 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SALL3Q9BXA9 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SALL3Q9BXA9 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SALL3Q9BXA9 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SALL3Q9BXA9 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SALL3Q9BXA9 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SALL3Q9BXA9 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SALL3Q9BXA9 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SALL3Q9BXA9 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SALL3Q9BXA9 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SALL3Q9BXA9 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SALL3Q9BXA9 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SALL3Q9BXA9 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SALL3Q9BXA9 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SALL3Q9BXA9 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SALL3Q9BXA9 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SALL3Q9BXA9 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SALL3Q9BXA9 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SALL3Q9BXA9 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SALL3Q9BXA9 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SALL3Q9BXA9 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SALL3Q9BXA9 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SALL3Q9BXA9 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SALL3Q9BXA9 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SALL3Q9BXA9 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SALL3Q9BXA9 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SALL3Q9BXA9 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SALL3Q9BXA9 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SALL3Q9BXA9 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SALL3Q9BXA9 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SALL3Q9BXA9 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SALL3Q9BXA9 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SALL3Q9BXA9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SALL3Q9BXA9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SALL3Q9BXA9 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms