Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWX5

GATA5, Transcription factor GATA-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA5Q9BWX5 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GATA5Q9BWX5 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
GATA5Q9BWX5 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GATA5Q9BWX5 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GATA5Q9BWX5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GATA5Q9BWX5 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GATA5Q9BWX5 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GATA5Q9BWX5 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GATA5Q9BWX5 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GATA5Q9BWX5 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GATA5Q9BWX5 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GATA5Q9BWX5 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GATA5Q9BWX5 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GATA5Q9BWX5 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GATA5Q9BWX5 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GATA5Q9BWX5 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GATA5Q9BWX5 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
GATA5Q9BWX5 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GATA5Q9BWX5 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GATA5Q9BWX5 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GATA5Q9BWX5 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GATA5Q9BWX5 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GATA5Q9BWX5 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GATA5Q9BWX5 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GATA5Q9BWX5 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GATA5Q9BWX5 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GATA5Q9BWX5 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
GATA5Q9BWX5 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GATA5Q9BWX5 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GATA5Q9BWX5 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GATA5Q9BWX5 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GATA5Q9BWX5 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GATA5Q9BWX5 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GATA5Q9BWX5 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GATA5Q9BWX5 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GATA5Q9BWX5 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GATA5Q9BWX5 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GATA5Q9BWX5 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GATA5Q9BWX5 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GATA5Q9BWX5 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GATA5Q9BWX5 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GATA5Q9BWX5 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GATA5Q9BWX5 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GATA5Q9BWX5 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GATA5Q9BWX5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GATA5Q9BWX5 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GATA5Q9BWX5 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GATA5Q9BWX5 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GATA5Q9BWX5 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GATA5Q9BWX5 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GATA5Q9BWX5 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GATA5Q9BWX5 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GATA5Q9BWX5 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GATA5Q9BWX5 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GATA5Q9BWX5 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GATA5Q9BWX5 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GATA5Q9BWX5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GATA5Q9BWX5 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GATA5Q9BWX5 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GATA5Q9BWX5 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GATA5Q9BWX5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GATA5Q9BWX5 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GATA5Q9BWX5 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GATA5Q9BWX5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
GATA5Q9BWX5 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GATA5Q9BWX5 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GATA5Q9BWX5 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GATA5Q9BWX5 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GATA5Q9BWX5 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GATA5Q9BWX5 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GATA5Q9BWX5 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GATA5Q9BWX5 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GATA5Q9BWX5 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GATA5Q9BWX5 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GATA5Q9BWX5 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GATA5Q9BWX5 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GATA5Q9BWX5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GATA5Q9BWX5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GATA5Q9BWX5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
GATA5Q9BWX5 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GATA5Q9BWX5 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GATA5Q9BWX5 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GATA5Q9BWX5 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GATA5Q9BWX5 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GATA5Q9BWX5 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GATA5Q9BWX5 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GATA5Q9BWX5 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GATA5Q9BWX5 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GATA5Q9BWX5 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GATA5Q9BWX5 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GATA5Q9BWX5 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GATA5Q9BWX5 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GATA5Q9BWX5 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GATA5Q9BWX5 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GATA5Q9BWX5 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GATA5Q9BWX5 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GATA5Q9BWX5 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GATA5Q9BWX5 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GATA5Q9BWX5 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GATA5Q9BWX5 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms