Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWT1

CDCA7, Cell division cycle-associated protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA7Q9BWT1 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CDCA7Q9BWT1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CDCA7Q9BWT1 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CDCA7Q9BWT1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CDCA7Q9BWT1 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CDCA7Q9BWT1 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CDCA7Q9BWT1 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CDCA7Q9BWT1 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CDCA7Q9BWT1 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CDCA7Q9BWT1 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CDCA7Q9BWT1 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CDCA7Q9BWT1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CDCA7Q9BWT1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CDCA7Q9BWT1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CDCA7Q9BWT1 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CDCA7Q9BWT1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDCA7Q9BWT1 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDCA7Q9BWT1 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDCA7Q9BWT1 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CDCA7Q9BWT1 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDCA7Q9BWT1 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDCA7Q9BWT1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDCA7Q9BWT1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDCA7Q9BWT1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDCA7Q9BWT1 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDCA7Q9BWT1 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDCA7Q9BWT1 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDCA7Q9BWT1 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDCA7Q9BWT1 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDCA7Q9BWT1 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDCA7Q9BWT1 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDCA7Q9BWT1 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDCA7Q9BWT1 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDCA7Q9BWT1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDCA7Q9BWT1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDCA7Q9BWT1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDCA7Q9BWT1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDCA7Q9BWT1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDCA7Q9BWT1 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDCA7Q9BWT1 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDCA7Q9BWT1 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDCA7Q9BWT1 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDCA7Q9BWT1 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDCA7Q9BWT1 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDCA7Q9BWT1 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDCA7Q9BWT1 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDCA7Q9BWT1 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CDCA7Q9BWT1 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CDCA7Q9BWT1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDCA7Q9BWT1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDCA7Q9BWT1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDCA7Q9BWT1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDCA7Q9BWT1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CDCA7Q9BWT1 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDCA7Q9BWT1 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDCA7Q9BWT1 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDCA7Q9BWT1 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CDCA7Q9BWT1 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDCA7Q9BWT1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDCA7Q9BWT1 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDCA7Q9BWT1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDCA7Q9BWT1 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDCA7Q9BWT1 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDCA7Q9BWT1 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDCA7Q9BWT1 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDCA7Q9BWT1 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CDCA7Q9BWT1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDCA7Q9BWT1 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDCA7Q9BWT1 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDCA7Q9BWT1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDCA7Q9BWT1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDCA7Q9BWT1 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDCA7Q9BWT1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CDCA7Q9BWT1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CDCA7Q9BWT1 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CDCA7Q9BWT1 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CDCA7Q9BWT1 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CDCA7Q9BWT1 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CDCA7Q9BWT1 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CDCA7Q9BWT1 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CDCA7Q9BWT1 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CDCA7Q9BWT1 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CDCA7Q9BWT1 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CDCA7Q9BWT1 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CDCA7Q9BWT1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDCA7Q9BWT1 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDCA7Q9BWT1 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDCA7Q9BWT1 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDCA7Q9BWT1 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CDCA7Q9BWT1 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDCA7Q9BWT1 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDCA7Q9BWT1 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDCA7Q9BWT1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDCA7Q9BWT1 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDCA7Q9BWT1 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDCA7Q9BWT1 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDCA7Q9BWT1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDCA7Q9BWT1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDCA7Q9BWT1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDCA7Q9BWT1 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms