Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSBP4Q9BWG4 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms