Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVW6

SMIM2, Small integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM2Q9BVW6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM2Q9BVW6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM2Q9BVW6 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM2Q9BVW6 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM2Q9BVW6 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM2Q9BVW6 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM2Q9BVW6 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM2Q9BVW6 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM2Q9BVW6 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM2Q9BVW6 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM2Q9BVW6 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM2Q9BVW6 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM2Q9BVW6 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM2Q9BVW6 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM2Q9BVW6 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM2Q9BVW6 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM2Q9BVW6 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM2Q9BVW6 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM2Q9BVW6 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM2Q9BVW6 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM2Q9BVW6 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM2Q9BVW6 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM2Q9BVW6 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM2Q9BVW6 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM2Q9BVW6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM2Q9BVW6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM2Q9BVW6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM2Q9BVW6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM2Q9BVW6 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM2Q9BVW6 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM2Q9BVW6 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SMIM2Q9BVW6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM2Q9BVW6 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM2Q9BVW6 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM2Q9BVW6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM2Q9BVW6 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM2Q9BVW6 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM2Q9BVW6 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SMIM2Q9BVW6 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SMIM2Q9BVW6 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SMIM2Q9BVW6 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SMIM2Q9BVW6 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SMIM2Q9BVW6 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SMIM2Q9BVW6 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SMIM2Q9BVW6 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SMIM2Q9BVW6 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SMIM2Q9BVW6 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SMIM2Q9BVW6 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SMIM2Q9BVW6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM2Q9BVW6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SMIM2Q9BVW6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM2Q9BVW6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM2Q9BVW6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM2Q9BVW6 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM2Q9BVW6 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM2Q9BVW6 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM2Q9BVW6 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM2Q9BVW6 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SMIM2Q9BVW6 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM2Q9BVW6 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SMIM2Q9BVW6 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM2Q9BVW6 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM2Q9BVW6 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM2Q9BVW6 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM2Q9BVW6 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM2Q9BVW6 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM2Q9BVW6 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM2Q9BVW6 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM2Q9BVW6 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM2Q9BVW6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM2Q9BVW6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM2Q9BVW6 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM2Q9BVW6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM2Q9BVW6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM2Q9BVW6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM2Q9BVW6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM2Q9BVW6 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM2Q9BVW6 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM2Q9BVW6 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SMIM2Q9BVW6 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM2Q9BVW6 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM2Q9BVW6 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM2Q9BVW6 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM2Q9BVW6 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM2Q9BVW6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM2Q9BVW6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM2Q9BVW6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM2Q9BVW6 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM2Q9BVW6 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM2Q9BVW6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SMIM2Q9BVW6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM2Q9BVW6 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM2Q9BVW6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM2Q9BVW6 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SMIM2Q9BVW6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SMIM2Q9BVW6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM2Q9BVW6 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM2Q9BVW6 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM2Q9BVW6 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SMIM2Q9BVW6 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms