Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSJ2

TUBGCP2, Gamma-tubulin complex component 2, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP2Q9BSJ2 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
TUBGCP2Q9BSJ2 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TUBGCP2Q9BSJ2 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TUBGCP2Q9BSJ2 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TUBGCP2Q9BSJ2 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TUBGCP2Q9BSJ2 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TUBGCP2Q9BSJ2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TUBGCP2Q9BSJ2 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TUBGCP2Q9BSJ2 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TUBGCP2Q9BSJ2 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TUBGCP2Q9BSJ2 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TUBGCP2Q9BSJ2 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBGCP2Q9BSJ2 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBGCP2Q9BSJ2 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBGCP2Q9BSJ2 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBGCP2Q9BSJ2 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBGCP2Q9BSJ2 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBGCP2Q9BSJ2 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBGCP2Q9BSJ2 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBGCP2Q9BSJ2 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBGCP2Q9BSJ2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBGCP2Q9BSJ2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBGCP2Q9BSJ2 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBGCP2Q9BSJ2 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBGCP2Q9BSJ2 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBGCP2Q9BSJ2 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBGCP2Q9BSJ2 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBGCP2Q9BSJ2 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBGCP2Q9BSJ2 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBGCP2Q9BSJ2 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBGCP2Q9BSJ2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBGCP2Q9BSJ2 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBGCP2Q9BSJ2 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBGCP2Q9BSJ2 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBGCP2Q9BSJ2 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBGCP2Q9BSJ2 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBGCP2Q9BSJ2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBGCP2Q9BSJ2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBGCP2Q9BSJ2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBGCP2Q9BSJ2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBGCP2Q9BSJ2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBGCP2Q9BSJ2 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBGCP2Q9BSJ2 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBGCP2Q9BSJ2 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBGCP2Q9BSJ2 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBGCP2Q9BSJ2 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBGCP2Q9BSJ2 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBGCP2Q9BSJ2 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBGCP2Q9BSJ2 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBGCP2Q9BSJ2 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBGCP2Q9BSJ2 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBGCP2Q9BSJ2 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBGCP2Q9BSJ2 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBGCP2Q9BSJ2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBGCP2Q9BSJ2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBGCP2Q9BSJ2 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBGCP2Q9BSJ2 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBGCP2Q9BSJ2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBGCP2Q9BSJ2 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBGCP2Q9BSJ2 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBGCP2Q9BSJ2 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBGCP2Q9BSJ2 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBGCP2Q9BSJ2 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBGCP2Q9BSJ2 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBGCP2Q9BSJ2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBGCP2Q9BSJ2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBGCP2Q9BSJ2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBGCP2Q9BSJ2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBGCP2Q9BSJ2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBGCP2Q9BSJ2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBGCP2Q9BSJ2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBGCP2Q9BSJ2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBGCP2Q9BSJ2 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBGCP2Q9BSJ2 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBGCP2Q9BSJ2 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBGCP2Q9BSJ2 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBGCP2Q9BSJ2 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBGCP2Q9BSJ2 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBGCP2Q9BSJ2 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBGCP2Q9BSJ2 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBGCP2Q9BSJ2 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBGCP2Q9BSJ2 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBGCP2Q9BSJ2 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBGCP2Q9BSJ2 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBGCP2Q9BSJ2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBGCP2Q9BSJ2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBGCP2Q9BSJ2 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBGCP2Q9BSJ2 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBGCP2Q9BSJ2 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBGCP2Q9BSJ2 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBGCP2Q9BSJ2 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBGCP2Q9BSJ2 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBGCP2Q9BSJ2 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBGCP2Q9BSJ2 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBGCP2Q9BSJ2 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBGCP2Q9BSJ2 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBGCP2Q9BSJ2 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBGCP2Q9BSJ2 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBGCP2Q9BSJ2 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBGCP2Q9BSJ2 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms