Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL6

SRSF8, Serine/arginine-rich splicing factor 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF8Q9BRL6 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SRSF8Q9BRL6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRSF8Q9BRL6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRSF8Q9BRL6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRSF8Q9BRL6 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRSF8Q9BRL6 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRSF8Q9BRL6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRSF8Q9BRL6 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRSF8Q9BRL6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRSF8Q9BRL6 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRSF8Q9BRL6 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRSF8Q9BRL6 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRSF8Q9BRL6 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRSF8Q9BRL6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRSF8Q9BRL6 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRSF8Q9BRL6 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRSF8Q9BRL6 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRSF8Q9BRL6 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SRSF8Q9BRL6 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRSF8Q9BRL6 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRSF8Q9BRL6 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRSF8Q9BRL6 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRSF8Q9BRL6 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SRSF8Q9BRL6 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRSF8Q9BRL6 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRSF8Q9BRL6 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRSF8Q9BRL6 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRSF8Q9BRL6 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SRSF8Q9BRL6 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRSF8Q9BRL6 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRSF8Q9BRL6 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRSF8Q9BRL6 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRSF8Q9BRL6 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRSF8Q9BRL6 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRSF8Q9BRL6 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SRSF8Q9BRL6 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRSF8Q9BRL6 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRSF8Q9BRL6 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRSF8Q9BRL6 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRSF8Q9BRL6 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SRSF8Q9BRL6 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRSF8Q9BRL6 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRSF8Q9BRL6 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRSF8Q9BRL6 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRSF8Q9BRL6 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SRSF8Q9BRL6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRSF8Q9BRL6 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRSF8Q9BRL6 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRSF8Q9BRL6 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRSF8Q9BRL6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SRSF8Q9BRL6 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRSF8Q9BRL6 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRSF8Q9BRL6 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRSF8Q9BRL6 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRSF8Q9BRL6 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRSF8Q9BRL6 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRSF8Q9BRL6 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRSF8Q9BRL6 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRSF8Q9BRL6 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRSF8Q9BRL6 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SRSF8Q9BRL6 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF8Q9BRL6 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF8Q9BRL6 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF8Q9BRL6 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF8Q9BRL6 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF8Q9BRL6 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF8Q9BRL6 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF8Q9BRL6 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF8Q9BRL6 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF8Q9BRL6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF8Q9BRL6 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF8Q9BRL6 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF8Q9BRL6 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF8Q9BRL6 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF8Q9BRL6 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF8Q9BRL6 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF8Q9BRL6 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF8Q9BRL6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF8Q9BRL6 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF8Q9BRL6 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF8Q9BRL6 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF8Q9BRL6 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF8Q9BRL6 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF8Q9BRL6 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF8Q9BRL6 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF8Q9BRL6 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF8Q9BRL6 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SRSF8Q9BRL6 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF8Q9BRL6 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF8Q9BRL6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF8Q9BRL6 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF8Q9BRL6 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF8Q9BRL6 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF8Q9BRL6 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF8Q9BRL6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF8Q9BRL6 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF8Q9BRL6 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF8Q9BRL6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF8Q9BRL6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SRSF8Q9BRL6 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms