Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK5

SDF4, 45 kDa calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDF4Q9BRK5 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SDF4Q9BRK5 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SDF4Q9BRK5 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SDF4Q9BRK5 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SDF4Q9BRK5 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SDF4Q9BRK5 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SDF4Q9BRK5 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SDF4Q9BRK5 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SDF4Q9BRK5 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SDF4Q9BRK5 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SDF4Q9BRK5 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SDF4Q9BRK5 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SDF4Q9BRK5 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SDF4Q9BRK5 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SDF4Q9BRK5 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SDF4Q9BRK5 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SDF4Q9BRK5 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SDF4Q9BRK5 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SDF4Q9BRK5 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SDF4Q9BRK5 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SDF4Q9BRK5 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SDF4Q9BRK5 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SDF4Q9BRK5 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SDF4Q9BRK5 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SDF4Q9BRK5 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SDF4Q9BRK5 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SDF4Q9BRK5 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SDF4Q9BRK5 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SDF4Q9BRK5 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SDF4Q9BRK5 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SDF4Q9BRK5 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SDF4Q9BRK5 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SDF4Q9BRK5 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SDF4Q9BRK5 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SDF4Q9BRK5 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SDF4Q9BRK5 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SDF4Q9BRK5 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SDF4Q9BRK5 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SDF4Q9BRK5 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SDF4Q9BRK5 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SDF4Q9BRK5 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SDF4Q9BRK5 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SDF4Q9BRK5 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SDF4Q9BRK5 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SDF4Q9BRK5 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SDF4Q9BRK5 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SDF4Q9BRK5 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SDF4Q9BRK5 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SDF4Q9BRK5 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SDF4Q9BRK5 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SDF4Q9BRK5 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SDF4Q9BRK5 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SDF4Q9BRK5 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SDF4Q9BRK5 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SDF4Q9BRK5 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SDF4Q9BRK5 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SDF4Q9BRK5 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SDF4Q9BRK5 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SDF4Q9BRK5 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SDF4Q9BRK5 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SDF4Q9BRK5 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SDF4Q9BRK5 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SDF4Q9BRK5 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SDF4Q9BRK5 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SDF4Q9BRK5 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SDF4Q9BRK5 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SDF4Q9BRK5 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SDF4Q9BRK5 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SDF4Q9BRK5 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SDF4Q9BRK5 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SDF4Q9BRK5 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SDF4Q9BRK5 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SDF4Q9BRK5 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SDF4Q9BRK5 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SDF4Q9BRK5 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SDF4Q9BRK5 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SDF4Q9BRK5 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SDF4Q9BRK5 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SDF4Q9BRK5 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SDF4Q9BRK5 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SDF4Q9BRK5 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SDF4Q9BRK5 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SDF4Q9BRK5 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SDF4Q9BRK5 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SDF4Q9BRK5 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SDF4Q9BRK5 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SDF4Q9BRK5 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SDF4Q9BRK5 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SDF4Q9BRK5 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SDF4Q9BRK5 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SDF4Q9BRK5 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SDF4Q9BRK5 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SDF4Q9BRK5 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SDF4Q9BRK5 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SDF4Q9BRK5 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SDF4Q9BRK5 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SDF4Q9BRK5 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SDF4Q9BRK5 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SDF4Q9BRK5 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SDF4Q9BRK5 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms