Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR77

CCDC77, Coiled-coil domain-containing protein 77, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC77Q9BR77 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC77Q9BR77 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC77Q9BR77 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC77Q9BR77 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC77Q9BR77 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC77Q9BR77 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC77Q9BR77 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC77Q9BR77 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC77Q9BR77 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC77Q9BR77 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC77Q9BR77 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC77Q9BR77 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC77Q9BR77 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC77Q9BR77 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC77Q9BR77 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC77Q9BR77 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC77Q9BR77 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC77Q9BR77 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC77Q9BR77 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC77Q9BR77 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC77Q9BR77 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC77Q9BR77 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC77Q9BR77 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC77Q9BR77 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC77Q9BR77 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC77Q9BR77 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC77Q9BR77 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC77Q9BR77 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC77Q9BR77 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC77Q9BR77 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC77Q9BR77 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC77Q9BR77 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC77Q9BR77 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC77Q9BR77 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC77Q9BR77 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC77Q9BR77 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC77Q9BR77 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC77Q9BR77 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC77Q9BR77 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC77Q9BR77 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC77Q9BR77 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC77Q9BR77 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC77Q9BR77 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC77Q9BR77 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC77Q9BR77 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC77Q9BR77 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC77Q9BR77 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC77Q9BR77 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC77Q9BR77 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC77Q9BR77 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC77Q9BR77 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC77Q9BR77 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC77Q9BR77 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC77Q9BR77 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC77Q9BR77 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC77Q9BR77 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC77Q9BR77 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC77Q9BR77 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC77Q9BR77 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC77Q9BR77 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC77Q9BR77 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC77Q9BR77 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC77Q9BR77 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC77Q9BR77 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC77Q9BR77 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC77Q9BR77 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC77Q9BR77 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC77Q9BR77 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC77Q9BR77 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC77Q9BR77 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC77Q9BR77 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC77Q9BR77 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC77Q9BR77 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC77Q9BR77 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC77Q9BR77 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC77Q9BR77 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC77Q9BR77 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC77Q9BR77 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC77Q9BR77 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC77Q9BR77 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC77Q9BR77 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC77Q9BR77 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC77Q9BR77 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC77Q9BR77 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC77Q9BR77 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC77Q9BR77 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC77Q9BR77 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC77Q9BR77 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC77Q9BR77 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC77Q9BR77 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC77Q9BR77 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC77Q9BR77 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC77Q9BR77 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC77Q9BR77 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC77Q9BR77 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC77Q9BR77 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC77Q9BR77 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC77Q9BR77 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC77Q9BR77 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC77Q9BR77 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms