Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SGIP1Q9BQI5 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SGIP1Q9BQI5 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SGIP1Q9BQI5 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SGIP1Q9BQI5 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SGIP1Q9BQI5 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SGIP1Q9BQI5 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SGIP1Q9BQI5 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SGIP1Q9BQI5 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SGIP1Q9BQI5 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SGIP1Q9BQI5 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SGIP1Q9BQI5 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SGIP1Q9BQI5 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SGIP1Q9BQI5 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SGIP1Q9BQI5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SGIP1Q9BQI5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SGIP1Q9BQI5 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SGIP1Q9BQI5 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SGIP1Q9BQI5 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SGIP1Q9BQI5 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SGIP1Q9BQI5 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SGIP1Q9BQI5 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SGIP1Q9BQI5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SGIP1Q9BQI5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SGIP1Q9BQI5 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SGIP1Q9BQI5 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SGIP1Q9BQI5 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SGIP1Q9BQI5 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SGIP1Q9BQI5 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SGIP1Q9BQI5 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SGIP1Q9BQI5 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SGIP1Q9BQI5 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SGIP1Q9BQI5 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SGIP1Q9BQI5 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SGIP1Q9BQI5 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SGIP1Q9BQI5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SGIP1Q9BQI5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SGIP1Q9BQI5 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SGIP1Q9BQI5 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SGIP1Q9BQI5 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SGIP1Q9BQI5 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SGIP1Q9BQI5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SGIP1Q9BQI5 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SGIP1Q9BQI5 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SGIP1Q9BQI5 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SGIP1Q9BQI5 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SGIP1Q9BQI5 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SGIP1Q9BQI5 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SGIP1Q9BQI5 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SGIP1Q9BQI5 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SGIP1Q9BQI5 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SGIP1Q9BQI5 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SGIP1Q9BQI5 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SGIP1Q9BQI5 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SGIP1Q9BQI5 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SGIP1Q9BQI5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SGIP1Q9BQI5 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SGIP1Q9BQI5 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SGIP1Q9BQI5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SGIP1Q9BQI5 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SGIP1Q9BQI5 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SGIP1Q9BQI5 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SGIP1Q9BQI5 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SGIP1Q9BQI5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SGIP1Q9BQI5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SGIP1Q9BQI5 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SGIP1Q9BQI5 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SGIP1Q9BQI5 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SGIP1Q9BQI5 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SGIP1Q9BQI5 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SGIP1Q9BQI5 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SGIP1Q9BQI5 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SGIP1Q9BQI5 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SGIP1Q9BQI5 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SGIP1Q9BQI5 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SGIP1Q9BQI5 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SGIP1Q9BQI5 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SGIP1Q9BQI5 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
SGIP1Q9BQI5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SGIP1Q9BQI5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SGIP1Q9BQI5 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SGIP1Q9BQI5 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SGIP1Q9BQI5 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SGIP1Q9BQI5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SGIP1Q9BQI5 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SGIP1Q9BQI5 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SGIP1Q9BQI5 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SGIP1Q9BQI5 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SGIP1Q9BQI5 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SGIP1Q9BQI5 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SGIP1Q9BQI5 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SGIP1Q9BQI5 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SGIP1Q9BQI5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SGIP1Q9BQI5 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SGIP1Q9BQI5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SGIP1Q9BQI5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SGIP1Q9BQI5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SGIP1Q9BQI5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SGIP1Q9BQI5 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SGIP1Q9BQI5 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms