Protein–RNA interactions for Protein: Q99758

ABCA3, ATP-binding cassette sub-family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCA3Q99758 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ABCA3Q99758 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ABCA3Q99758 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ABCA3Q99758 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ABCA3Q99758 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ABCA3Q99758 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ABCA3Q99758 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ABCA3Q99758 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ABCA3Q99758 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
ABCA3Q99758 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ABCA3Q99758 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ABCA3Q99758 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ABCA3Q99758 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ABCA3Q99758 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ABCA3Q99758 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ABCA3Q99758 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ABCA3Q99758 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ABCA3Q99758 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ABCA3Q99758 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ABCA3Q99758 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ABCA3Q99758 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ABCA3Q99758 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ABCA3Q99758 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
ABCA3Q99758 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ABCA3Q99758 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ABCA3Q99758 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ABCA3Q99758 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ABCA3Q99758 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ABCA3Q99758 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ABCA3Q99758 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ABCA3Q99758 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ABCA3Q99758 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ABCA3Q99758 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ABCA3Q99758 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ABCA3Q99758 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ABCA3Q99758 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ABCA3Q99758 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ABCA3Q99758 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ABCA3Q99758 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ABCA3Q99758 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ABCA3Q99758 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ABCA3Q99758 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ABCA3Q99758 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
ABCA3Q99758 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCA3Q99758 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCA3Q99758 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCA3Q99758 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCA3Q99758 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCA3Q99758 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCA3Q99758 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCA3Q99758 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCA3Q99758 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCA3Q99758 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCA3Q99758 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCA3Q99758 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCA3Q99758 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCA3Q99758 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCA3Q99758 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCA3Q99758 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ABCA3Q99758 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCA3Q99758 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCA3Q99758 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCA3Q99758 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCA3Q99758 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCA3Q99758 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCA3Q99758 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ABCA3Q99758 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ABCA3Q99758 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ABCA3Q99758 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
ABCA3Q99758 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ABCA3Q99758 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ABCA3Q99758 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ABCA3Q99758 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ABCA3Q99758 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ABCA3Q99758 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ABCA3Q99758 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ABCA3Q99758 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ABCA3Q99758 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
ABCA3Q99758 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ABCA3Q99758 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ABCA3Q99758 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ABCA3Q99758 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ABCA3Q99758 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ABCA3Q99758 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ABCA3Q99758 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ABCA3Q99758 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
ABCA3Q99758 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ABCA3Q99758 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ABCA3Q99758 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
ABCA3Q99758 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ABCA3Q99758 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ABCA3Q99758 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ABCA3Q99758 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ABCA3Q99758 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ABCA3Q99758 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ABCA3Q99758 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ABCA3Q99758 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ABCA3Q99758 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ABCA3Q99758 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ABCA3Q99758 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms