Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PITX2Q99697 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PITX2Q99697 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PITX2Q99697 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PITX2Q99697 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PITX2Q99697 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PITX2Q99697 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PITX2Q99697 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PITX2Q99697 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PITX2Q99697 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PITX2Q99697 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PITX2Q99697 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PITX2Q99697 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PITX2Q99697 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PITX2Q99697 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PITX2Q99697 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PITX2Q99697 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PITX2Q99697 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PITX2Q99697 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PITX2Q99697 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PITX2Q99697 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PITX2Q99697 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PITX2Q99697 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PITX2Q99697 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PITX2Q99697 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PITX2Q99697 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PITX2Q99697 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PITX2Q99697 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PITX2Q99697 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PITX2Q99697 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PITX2Q99697 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PITX2Q99697 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PITX2Q99697 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PITX2Q99697 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PITX2Q99697 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PITX2Q99697 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PITX2Q99697 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PITX2Q99697 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PITX2Q99697 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PITX2Q99697 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PITX2Q99697 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PITX2Q99697 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PITX2Q99697 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PITX2Q99697 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PITX2Q99697 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PITX2Q99697 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PITX2Q99697 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PITX2Q99697 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PITX2Q99697 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PITX2Q99697 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PITX2Q99697 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PITX2Q99697 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PITX2Q99697 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PITX2Q99697 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PITX2Q99697 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PITX2Q99697 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PITX2Q99697 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PITX2Q99697 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PITX2Q99697 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
PITX2Q99697 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PITX2Q99697 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PITX2Q99697 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PITX2Q99697 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PITX2Q99697 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PITX2Q99697 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PITX2Q99697 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PITX2Q99697 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PITX2Q99697 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PITX2Q99697 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PITX2Q99697 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PITX2Q99697 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PITX2Q99697 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PITX2Q99697 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PITX2Q99697 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PITX2Q99697 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PITX2Q99697 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PITX2Q99697 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PITX2Q99697 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PITX2Q99697 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PITX2Q99697 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PITX2Q99697 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PITX2Q99697 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms