Protein–RNA interactions for Protein: Q99618

CDCA3, Cell division cycle-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA3Q99618 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDCA3Q99618 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDCA3Q99618 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDCA3Q99618 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDCA3Q99618 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDCA3Q99618 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDCA3Q99618 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDCA3Q99618 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDCA3Q99618 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDCA3Q99618 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDCA3Q99618 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDCA3Q99618 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDCA3Q99618 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDCA3Q99618 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDCA3Q99618 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDCA3Q99618 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CDCA3Q99618 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDCA3Q99618 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDCA3Q99618 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDCA3Q99618 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDCA3Q99618 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDCA3Q99618 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDCA3Q99618 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDCA3Q99618 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDCA3Q99618 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDCA3Q99618 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDCA3Q99618 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDCA3Q99618 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDCA3Q99618 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDCA3Q99618 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CDCA3Q99618 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDCA3Q99618 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDCA3Q99618 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDCA3Q99618 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
CDCA3Q99618 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDCA3Q99618 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDCA3Q99618 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDCA3Q99618 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDCA3Q99618 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDCA3Q99618 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CDCA3Q99618 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDCA3Q99618 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDCA3Q99618 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDCA3Q99618 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDCA3Q99618 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDCA3Q99618 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDCA3Q99618 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDCA3Q99618 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDCA3Q99618 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDCA3Q99618 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDCA3Q99618 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDCA3Q99618 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDCA3Q99618 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDCA3Q99618 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDCA3Q99618 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDCA3Q99618 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDCA3Q99618 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CDCA3Q99618 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDCA3Q99618 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDCA3Q99618 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CDCA3Q99618 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDCA3Q99618 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDCA3Q99618 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDCA3Q99618 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDCA3Q99618 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDCA3Q99618 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDCA3Q99618 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDCA3Q99618 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDCA3Q99618 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDCA3Q99618 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDCA3Q99618 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDCA3Q99618 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDCA3Q99618 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDCA3Q99618 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDCA3Q99618 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDCA3Q99618 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDCA3Q99618 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDCA3Q99618 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDCA3Q99618 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDCA3Q99618 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDCA3Q99618 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDCA3Q99618 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CDCA3Q99618 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDCA3Q99618 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDCA3Q99618 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDCA3Q99618 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDCA3Q99618 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDCA3Q99618 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDCA3Q99618 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDCA3Q99618 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDCA3Q99618 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDCA3Q99618 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDCA3Q99618 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDCA3Q99618 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDCA3Q99618 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDCA3Q99618 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDCA3Q99618 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDCA3Q99618 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CDCA3Q99618 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CDCA3Q99618 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms