Protein–RNA interactions for Protein: Q99466

NOTCH4, Neurogenic locus notch homolog protein 4, humanhuman

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Length 2,003 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTCH4Q99466 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NOTCH4Q99466 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NOTCH4Q99466 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NOTCH4Q99466 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NOTCH4Q99466 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NOTCH4Q99466 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NOTCH4Q99466 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NOTCH4Q99466 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NOTCH4Q99466 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NOTCH4Q99466 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NOTCH4Q99466 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NOTCH4Q99466 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NOTCH4Q99466 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NOTCH4Q99466 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NOTCH4Q99466 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NOTCH4Q99466 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NOTCH4Q99466 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NOTCH4Q99466 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NOTCH4Q99466 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NOTCH4Q99466 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NOTCH4Q99466 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NOTCH4Q99466 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NOTCH4Q99466 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NOTCH4Q99466 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NOTCH4Q99466 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NOTCH4Q99466 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NOTCH4Q99466 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NOTCH4Q99466 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NOTCH4Q99466 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NOTCH4Q99466 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NOTCH4Q99466 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NOTCH4Q99466 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NOTCH4Q99466 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NOTCH4Q99466 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NOTCH4Q99466 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NOTCH4Q99466 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NOTCH4Q99466 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NOTCH4Q99466 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NOTCH4Q99466 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NOTCH4Q99466 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NOTCH4Q99466 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NOTCH4Q99466 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NOTCH4Q99466 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NOTCH4Q99466 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NOTCH4Q99466 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NOTCH4Q99466 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NOTCH4Q99466 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NOTCH4Q99466 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NOTCH4Q99466 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NOTCH4Q99466 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NOTCH4Q99466 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NOTCH4Q99466 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NOTCH4Q99466 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NOTCH4Q99466 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NOTCH4Q99466 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NOTCH4Q99466 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NOTCH4Q99466 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NOTCH4Q99466 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NOTCH4Q99466 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NOTCH4Q99466 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NOTCH4Q99466 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NOTCH4Q99466 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NOTCH4Q99466 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NOTCH4Q99466 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NOTCH4Q99466 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NOTCH4Q99466 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NOTCH4Q99466 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NOTCH4Q99466 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NOTCH4Q99466 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NOTCH4Q99466 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NOTCH4Q99466 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NOTCH4Q99466 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NOTCH4Q99466 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NOTCH4Q99466 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NOTCH4Q99466 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NOTCH4Q99466 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NOTCH4Q99466 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NOTCH4Q99466 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NOTCH4Q99466 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NOTCH4Q99466 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NOTCH4Q99466 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NOTCH4Q99466 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NOTCH4Q99466 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NOTCH4Q99466 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NOTCH4Q99466 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NOTCH4Q99466 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NOTCH4Q99466 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NOTCH4Q99466 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NOTCH4Q99466 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NOTCH4Q99466 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NOTCH4Q99466 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NOTCH4Q99466 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NOTCH4Q99466 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NOTCH4Q99466 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NOTCH4Q99466 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NOTCH4Q99466 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NOTCH4Q99466 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NOTCH4Q99466 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NOTCH4Q99466 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NOTCH4Q99466 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
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