Protein–RNA interactions for Protein: Q96T76

MMS19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMS19Q96T76 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MMS19Q96T76 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MMS19Q96T76 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MMS19Q96T76 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MMS19Q96T76 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MMS19Q96T76 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MMS19Q96T76 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MMS19Q96T76 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MMS19Q96T76 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MMS19Q96T76 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MMS19Q96T76 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MMS19Q96T76 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MMS19Q96T76 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MMS19Q96T76 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MMS19Q96T76 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MMS19Q96T76 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MMS19Q96T76 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MMS19Q96T76 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MMS19Q96T76 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MMS19Q96T76 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MMS19Q96T76 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MMS19Q96T76 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MMS19Q96T76 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MMS19Q96T76 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MMS19Q96T76 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MMS19Q96T76 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MMS19Q96T76 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MMS19Q96T76 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MMS19Q96T76 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MMS19Q96T76 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
MMS19Q96T76 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MMS19Q96T76 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MMS19Q96T76 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MMS19Q96T76 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MMS19Q96T76 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MMS19Q96T76 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MMS19Q96T76 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MMS19Q96T76 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MMS19Q96T76 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MMS19Q96T76 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MMS19Q96T76 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MMS19Q96T76 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MMS19Q96T76 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MMS19Q96T76 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MMS19Q96T76 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
MMS19Q96T76 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MMS19Q96T76 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MMS19Q96T76 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MMS19Q96T76 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MMS19Q96T76 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MMS19Q96T76 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MMS19Q96T76 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MMS19Q96T76 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MMS19Q96T76 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MMS19Q96T76 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MMS19Q96T76 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
MMS19Q96T76 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MMS19Q96T76 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MMS19Q96T76 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MMS19Q96T76 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MMS19Q96T76 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MMS19Q96T76 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MMS19Q96T76 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MMS19Q96T76 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMS19Q96T76 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMS19Q96T76 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMS19Q96T76 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MMS19Q96T76 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMS19Q96T76 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMS19Q96T76 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMS19Q96T76 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMS19Q96T76 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMS19Q96T76 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMS19Q96T76 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMS19Q96T76 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MMS19Q96T76 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMS19Q96T76 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMS19Q96T76 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMS19Q96T76 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMS19Q96T76 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MMS19Q96T76 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MMS19Q96T76 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MMS19Q96T76 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MMS19Q96T76 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MMS19Q96T76 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MMS19Q96T76 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MMS19Q96T76 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MMS19Q96T76 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MMS19Q96T76 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MMS19Q96T76 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MMS19Q96T76 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MMS19Q96T76 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MMS19Q96T76 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MMS19Q96T76 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MMS19Q96T76 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MMS19Q96T76 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MMS19Q96T76 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MMS19Q96T76 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MMS19Q96T76 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MMS19Q96T76 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms