Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
SIN3AQ96ST3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
SIN3AQ96ST3 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
SIN3AQ96ST3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
SIN3AQ96ST3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
SIN3AQ96ST3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
SIN3AQ96ST3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
SIN3AQ96ST3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
SIN3AQ96ST3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
SIN3AQ96ST3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
SIN3AQ96ST3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
SIN3AQ96ST3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
SIN3AQ96ST3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
SIN3AQ96ST3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
SIN3AQ96ST3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
SIN3AQ96ST3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
SIN3AQ96ST3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
SIN3AQ96ST3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
SIN3AQ96ST3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
SIN3AQ96ST3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
SIN3AQ96ST3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
SIN3AQ96ST3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
SIN3AQ96ST3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
SIN3AQ96ST3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
SIN3AQ96ST3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
SIN3AQ96ST3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
SIN3AQ96ST3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
SIN3AQ96ST3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
SIN3AQ96ST3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
SIN3AQ96ST3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
SIN3AQ96ST3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
SIN3AQ96ST3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
SIN3AQ96ST3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
SIN3AQ96ST3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
SIN3AQ96ST3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
SIN3AQ96ST3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
SIN3AQ96ST3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
SIN3AQ96ST3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
SIN3AQ96ST3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SIN3AQ96ST3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SIN3AQ96ST3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SIN3AQ96ST3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SIN3AQ96ST3 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
SIN3AQ96ST3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SIN3AQ96ST3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SIN3AQ96ST3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
SIN3AQ96ST3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
SIN3AQ96ST3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SIN3AQ96ST3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SIN3AQ96ST3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
SIN3AQ96ST3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
SIN3AQ96ST3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
SIN3AQ96ST3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
SIN3AQ96ST3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
SIN3AQ96ST3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
SIN3AQ96ST3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
SIN3AQ96ST3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SIN3AQ96ST3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SIN3AQ96ST3 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
SIN3AQ96ST3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SIN3AQ96ST3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SIN3AQ96ST3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SIN3AQ96ST3 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SIN3AQ96ST3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SIN3AQ96ST3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SIN3AQ96ST3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SIN3AQ96ST3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
SIN3AQ96ST3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SIN3AQ96ST3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SIN3AQ96ST3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SIN3AQ96ST3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
SIN3AQ96ST3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
SIN3AQ96ST3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SIN3AQ96ST3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SIN3AQ96ST3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SIN3AQ96ST3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SIN3AQ96ST3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
SIN3AQ96ST3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SIN3AQ96ST3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SIN3AQ96ST3 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SIN3AQ96ST3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SIN3AQ96ST3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SIN3AQ96ST3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SIN3AQ96ST3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SIN3AQ96ST3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SIN3AQ96ST3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SIN3AQ96ST3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SIN3AQ96ST3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SIN3AQ96ST3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SIN3AQ96ST3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SIN3AQ96ST3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SIN3AQ96ST3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SIN3AQ96ST3 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SIN3AQ96ST3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SIN3AQ96ST3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
SIN3AQ96ST3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SIN3AQ96ST3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SIN3AQ96ST3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SIN3AQ96ST3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SIN3AQ96ST3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms