Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q91

SLC4A9, Anion exchange protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A9Q96Q91 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC4A9Q96Q91 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC4A9Q96Q91 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC4A9Q96Q91 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC4A9Q96Q91 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC4A9Q96Q91 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC4A9Q96Q91 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC4A9Q96Q91 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC4A9Q96Q91 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC4A9Q96Q91 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC4A9Q96Q91 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC4A9Q96Q91 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC4A9Q96Q91 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC4A9Q96Q91 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC4A9Q96Q91 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC4A9Q96Q91 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC4A9Q96Q91 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLC4A9Q96Q91 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SLC4A9Q96Q91 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
SLC4A9Q96Q91 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLC4A9Q96Q91 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
SLC4A9Q96Q91 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SLC4A9Q96Q91 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SLC4A9Q96Q91 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
SLC4A9Q96Q91 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SLC4A9Q96Q91 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SLC4A9Q96Q91 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SLC4A9Q96Q91 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLC4A9Q96Q91 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SLC4A9Q96Q91 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC4A9Q96Q91 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC4A9Q96Q91 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC4A9Q96Q91 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC4A9Q96Q91 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC4A9Q96Q91 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC4A9Q96Q91 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC4A9Q96Q91 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC4A9Q96Q91 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC4A9Q96Q91 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC4A9Q96Q91 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC4A9Q96Q91 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC4A9Q96Q91 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC4A9Q96Q91 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC4A9Q96Q91 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC4A9Q96Q91 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC4A9Q96Q91 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC4A9Q96Q91 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC4A9Q96Q91 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC4A9Q96Q91 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC4A9Q96Q91 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC4A9Q96Q91 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC4A9Q96Q91 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC4A9Q96Q91 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC4A9Q96Q91 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC4A9Q96Q91 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC4A9Q96Q91 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC4A9Q96Q91 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC4A9Q96Q91 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC4A9Q96Q91 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC4A9Q96Q91 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC4A9Q96Q91 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC4A9Q96Q91 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC4A9Q96Q91 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC4A9Q96Q91 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC4A9Q96Q91 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC4A9Q96Q91 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC4A9Q96Q91 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC4A9Q96Q91 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC4A9Q96Q91 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC4A9Q96Q91 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC4A9Q96Q91 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC4A9Q96Q91 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC4A9Q96Q91 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLC4A9Q96Q91 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SLC4A9Q96Q91 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SLC4A9Q96Q91 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SLC4A9Q96Q91 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC4A9Q96Q91 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC4A9Q96Q91 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC4A9Q96Q91 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC4A9Q96Q91 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC4A9Q96Q91 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC4A9Q96Q91 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC4A9Q96Q91 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC4A9Q96Q91 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC4A9Q96Q91 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC4A9Q96Q91 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC4A9Q96Q91 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC4A9Q96Q91 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC4A9Q96Q91 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC4A9Q96Q91 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC4A9Q96Q91 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC4A9Q96Q91 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC4A9Q96Q91 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC4A9Q96Q91 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC4A9Q96Q91 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC4A9Q96Q91 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC4A9Q96Q91 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC4A9Q96Q91 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC4A9Q96Q91 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms