Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP9

GBP4, Guanylate-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP4Q96PP9 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GBP4Q96PP9 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GBP4Q96PP9 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GBP4Q96PP9 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GBP4Q96PP9 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GBP4Q96PP9 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GBP4Q96PP9 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GBP4Q96PP9 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GBP4Q96PP9 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
GBP4Q96PP9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
GBP4Q96PP9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GBP4Q96PP9 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
GBP4Q96PP9 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GBP4Q96PP9 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GBP4Q96PP9 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GBP4Q96PP9 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GBP4Q96PP9 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GBP4Q96PP9 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GBP4Q96PP9 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GBP4Q96PP9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GBP4Q96PP9 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GBP4Q96PP9 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GBP4Q96PP9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GBP4Q96PP9 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GBP4Q96PP9 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GBP4Q96PP9 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GBP4Q96PP9 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GBP4Q96PP9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GBP4Q96PP9 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GBP4Q96PP9 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GBP4Q96PP9 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GBP4Q96PP9 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GBP4Q96PP9 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GBP4Q96PP9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GBP4Q96PP9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GBP4Q96PP9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GBP4Q96PP9 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GBP4Q96PP9 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GBP4Q96PP9 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
GBP4Q96PP9 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GBP4Q96PP9 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GBP4Q96PP9 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GBP4Q96PP9 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GBP4Q96PP9 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GBP4Q96PP9 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GBP4Q96PP9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GBP4Q96PP9 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GBP4Q96PP9 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
GBP4Q96PP9 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GBP4Q96PP9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GBP4Q96PP9 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GBP4Q96PP9 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GBP4Q96PP9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
GBP4Q96PP9 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GBP4Q96PP9 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GBP4Q96PP9 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GBP4Q96PP9 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GBP4Q96PP9 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GBP4Q96PP9 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GBP4Q96PP9 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GBP4Q96PP9 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GBP4Q96PP9 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GBP4Q96PP9 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GBP4Q96PP9 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GBP4Q96PP9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
GBP4Q96PP9 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GBP4Q96PP9 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GBP4Q96PP9 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GBP4Q96PP9 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GBP4Q96PP9 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GBP4Q96PP9 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GBP4Q96PP9 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GBP4Q96PP9 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GBP4Q96PP9 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GBP4Q96PP9 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GBP4Q96PP9 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GBP4Q96PP9 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GBP4Q96PP9 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GBP4Q96PP9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GBP4Q96PP9 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GBP4Q96PP9 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GBP4Q96PP9 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
GBP4Q96PP9 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GBP4Q96PP9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GBP4Q96PP9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GBP4Q96PP9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
GBP4Q96PP9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GBP4Q96PP9 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GBP4Q96PP9 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GBP4Q96PP9 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GBP4Q96PP9 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GBP4Q96PP9 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GBP4Q96PP9 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GBP4Q96PP9 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GBP4Q96PP9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GBP4Q96PP9 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GBP4Q96PP9 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GBP4Q96PP9 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GBP4Q96PP9 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GBP4Q96PP9 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms