Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW1

CCDC43, Coiled-coil domain-containing protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC43Q96MW1 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC43Q96MW1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC43Q96MW1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC43Q96MW1 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC43Q96MW1 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC43Q96MW1 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC43Q96MW1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC43Q96MW1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC43Q96MW1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC43Q96MW1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC43Q96MW1 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC43Q96MW1 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC43Q96MW1 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC43Q96MW1 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC43Q96MW1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC43Q96MW1 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC43Q96MW1 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC43Q96MW1 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC43Q96MW1 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC43Q96MW1 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC43Q96MW1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC43Q96MW1 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC43Q96MW1 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC43Q96MW1 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC43Q96MW1 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC43Q96MW1 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC43Q96MW1 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC43Q96MW1 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC43Q96MW1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC43Q96MW1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC43Q96MW1 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC43Q96MW1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC43Q96MW1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC43Q96MW1 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC43Q96MW1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC43Q96MW1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC43Q96MW1 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC43Q96MW1 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC43Q96MW1 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC43Q96MW1 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC43Q96MW1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC43Q96MW1 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC43Q96MW1 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC43Q96MW1 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC43Q96MW1 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC43Q96MW1 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC43Q96MW1 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC43Q96MW1 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC43Q96MW1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC43Q96MW1 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC43Q96MW1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC43Q96MW1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC43Q96MW1 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC43Q96MW1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC43Q96MW1 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC43Q96MW1 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC43Q96MW1 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC43Q96MW1 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC43Q96MW1 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC43Q96MW1 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC43Q96MW1 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC43Q96MW1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC43Q96MW1 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC43Q96MW1 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC43Q96MW1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC43Q96MW1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC43Q96MW1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC43Q96MW1 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC43Q96MW1 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC43Q96MW1 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC43Q96MW1 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC43Q96MW1 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC43Q96MW1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC43Q96MW1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC43Q96MW1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC43Q96MW1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC43Q96MW1 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC43Q96MW1 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC43Q96MW1 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC43Q96MW1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC43Q96MW1 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC43Q96MW1 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC43Q96MW1 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC43Q96MW1 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC43Q96MW1 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC43Q96MW1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC43Q96MW1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC43Q96MW1 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC43Q96MW1 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC43Q96MW1 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC43Q96MW1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC43Q96MW1 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC43Q96MW1 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC43Q96MW1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC43Q96MW1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC43Q96MW1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC43Q96MW1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC43Q96MW1 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC43Q96MW1 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC43Q96MW1 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms