Protein–RNA interactions for Protein: Q96MN9

ZNF488, Zinc finger protein 488, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF488Q96MN9 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF488Q96MN9 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF488Q96MN9 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF488Q96MN9 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZNF488Q96MN9 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF488Q96MN9 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF488Q96MN9 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF488Q96MN9 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF488Q96MN9 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF488Q96MN9 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF488Q96MN9 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF488Q96MN9 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF488Q96MN9 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF488Q96MN9 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF488Q96MN9 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF488Q96MN9 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZNF488Q96MN9 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF488Q96MN9 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF488Q96MN9 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF488Q96MN9 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF488Q96MN9 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF488Q96MN9 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF488Q96MN9 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF488Q96MN9 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF488Q96MN9 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF488Q96MN9 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF488Q96MN9 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF488Q96MN9 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF488Q96MN9 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF488Q96MN9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF488Q96MN9 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF488Q96MN9 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF488Q96MN9 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF488Q96MN9 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF488Q96MN9 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF488Q96MN9 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF488Q96MN9 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF488Q96MN9 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ZNF488Q96MN9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZNF488Q96MN9 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ZNF488Q96MN9 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF488Q96MN9 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF488Q96MN9 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF488Q96MN9 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF488Q96MN9 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF488Q96MN9 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF488Q96MN9 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF488Q96MN9 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF488Q96MN9 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF488Q96MN9 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF488Q96MN9 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF488Q96MN9 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF488Q96MN9 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF488Q96MN9 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ZNF488Q96MN9 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF488Q96MN9 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF488Q96MN9 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF488Q96MN9 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF488Q96MN9 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF488Q96MN9 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF488Q96MN9 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF488Q96MN9 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF488Q96MN9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF488Q96MN9 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF488Q96MN9 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF488Q96MN9 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF488Q96MN9 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF488Q96MN9 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ZNF488Q96MN9 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF488Q96MN9 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF488Q96MN9 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF488Q96MN9 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF488Q96MN9 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF488Q96MN9 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF488Q96MN9 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF488Q96MN9 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF488Q96MN9 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF488Q96MN9 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF488Q96MN9 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF488Q96MN9 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF488Q96MN9 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF488Q96MN9 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF488Q96MN9 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF488Q96MN9 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF488Q96MN9 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF488Q96MN9 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF488Q96MN9 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF488Q96MN9 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ZNF488Q96MN9 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF488Q96MN9 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF488Q96MN9 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF488Q96MN9 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF488Q96MN9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF488Q96MN9 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF488Q96MN9 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF488Q96MN9 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF488Q96MN9 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF488Q96MN9 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF488Q96MN9 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ZNF488Q96MN9 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms