Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG8

PCMTD1, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMTD1Q96MG8 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCMTD1Q96MG8 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCMTD1Q96MG8 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCMTD1Q96MG8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PCMTD1Q96MG8 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCMTD1Q96MG8 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PCMTD1Q96MG8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCMTD1Q96MG8 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCMTD1Q96MG8 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCMTD1Q96MG8 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCMTD1Q96MG8 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCMTD1Q96MG8 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCMTD1Q96MG8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCMTD1Q96MG8 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCMTD1Q96MG8 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCMTD1Q96MG8 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCMTD1Q96MG8 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCMTD1Q96MG8 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCMTD1Q96MG8 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCMTD1Q96MG8 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCMTD1Q96MG8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCMTD1Q96MG8 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCMTD1Q96MG8 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCMTD1Q96MG8 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCMTD1Q96MG8 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCMTD1Q96MG8 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCMTD1Q96MG8 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCMTD1Q96MG8 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCMTD1Q96MG8 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCMTD1Q96MG8 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCMTD1Q96MG8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCMTD1Q96MG8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCMTD1Q96MG8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCMTD1Q96MG8 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCMTD1Q96MG8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PCMTD1Q96MG8 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCMTD1Q96MG8 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCMTD1Q96MG8 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PCMTD1Q96MG8 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCMTD1Q96MG8 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCMTD1Q96MG8 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCMTD1Q96MG8 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCMTD1Q96MG8 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCMTD1Q96MG8 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCMTD1Q96MG8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCMTD1Q96MG8 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCMTD1Q96MG8 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCMTD1Q96MG8 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCMTD1Q96MG8 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCMTD1Q96MG8 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCMTD1Q96MG8 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCMTD1Q96MG8 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCMTD1Q96MG8 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCMTD1Q96MG8 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCMTD1Q96MG8 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCMTD1Q96MG8 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCMTD1Q96MG8 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCMTD1Q96MG8 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCMTD1Q96MG8 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCMTD1Q96MG8 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCMTD1Q96MG8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCMTD1Q96MG8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PCMTD1Q96MG8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PCMTD1Q96MG8 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCMTD1Q96MG8 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCMTD1Q96MG8 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCMTD1Q96MG8 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PCMTD1Q96MG8 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCMTD1Q96MG8 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCMTD1Q96MG8 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCMTD1Q96MG8 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCMTD1Q96MG8 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCMTD1Q96MG8 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCMTD1Q96MG8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCMTD1Q96MG8 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCMTD1Q96MG8 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PCMTD1Q96MG8 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCMTD1Q96MG8 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCMTD1Q96MG8 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCMTD1Q96MG8 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCMTD1Q96MG8 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCMTD1Q96MG8 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCMTD1Q96MG8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCMTD1Q96MG8 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCMTD1Q96MG8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCMTD1Q96MG8 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PCMTD1Q96MG8 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PCMTD1Q96MG8 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PCMTD1Q96MG8 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCMTD1Q96MG8 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PCMTD1Q96MG8 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PCMTD1Q96MG8 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCMTD1Q96MG8 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
PCMTD1Q96MG8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PCMTD1Q96MG8 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PCMTD1Q96MG8 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PCMTD1Q96MG8 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PCMTD1Q96MG8 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
PCMTD1Q96MG8 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PCMTD1Q96MG8 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms