Protein–RNA interactions for Protein: Q96M63

CCDC114, Coiled-coil domain-containing protein 114, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC114Q96M63 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC114Q96M63 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC114Q96M63 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC114Q96M63 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC114Q96M63 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC114Q96M63 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC114Q96M63 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC114Q96M63 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC114Q96M63 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC114Q96M63 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC114Q96M63 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC114Q96M63 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC114Q96M63 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC114Q96M63 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC114Q96M63 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC114Q96M63 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC114Q96M63 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC114Q96M63 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC114Q96M63 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC114Q96M63 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC114Q96M63 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC114Q96M63 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC114Q96M63 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC114Q96M63 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC114Q96M63 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC114Q96M63 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC114Q96M63 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC114Q96M63 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC114Q96M63 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC114Q96M63 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC114Q96M63 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC114Q96M63 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC114Q96M63 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC114Q96M63 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC114Q96M63 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC114Q96M63 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC114Q96M63 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC114Q96M63 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC114Q96M63 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC114Q96M63 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC114Q96M63 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC114Q96M63 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC114Q96M63 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC114Q96M63 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC114Q96M63 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC114Q96M63 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC114Q96M63 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC114Q96M63 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC114Q96M63 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC114Q96M63 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC114Q96M63 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC114Q96M63 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC114Q96M63 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC114Q96M63 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC114Q96M63 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC114Q96M63 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC114Q96M63 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC114Q96M63 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC114Q96M63 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC114Q96M63 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC114Q96M63 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC114Q96M63 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC114Q96M63 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC114Q96M63 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC114Q96M63 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC114Q96M63 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC114Q96M63 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC114Q96M63 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC114Q96M63 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC114Q96M63 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC114Q96M63 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC114Q96M63 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC114Q96M63 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC114Q96M63 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC114Q96M63 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC114Q96M63 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC114Q96M63 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC114Q96M63 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC114Q96M63 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC114Q96M63 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC114Q96M63 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC114Q96M63 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC114Q96M63 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC114Q96M63 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC114Q96M63 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC114Q96M63 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC114Q96M63 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC114Q96M63 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC114Q96M63 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC114Q96M63 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC114Q96M63 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC114Q96M63 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC114Q96M63 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC114Q96M63 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC114Q96M63 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC114Q96M63 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC114Q96M63 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC114Q96M63 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC114Q96M63 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC114Q96M63 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms