Protein–RNA interactions for Protein: Q96M60

FAM227B, Protein FAM227B, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227BQ96M60 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FAM227BQ96M60 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FAM227BQ96M60 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FAM227BQ96M60 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FAM227BQ96M60 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FAM227BQ96M60 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FAM227BQ96M60 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FAM227BQ96M60 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FAM227BQ96M60 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FAM227BQ96M60 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FAM227BQ96M60 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
FAM227BQ96M60 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FAM227BQ96M60 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
FAM227BQ96M60 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FAM227BQ96M60 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FAM227BQ96M60 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FAM227BQ96M60 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FAM227BQ96M60 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FAM227BQ96M60 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
FAM227BQ96M60 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FAM227BQ96M60 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FAM227BQ96M60 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FAM227BQ96M60 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FAM227BQ96M60 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FAM227BQ96M60 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FAM227BQ96M60 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FAM227BQ96M60 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FAM227BQ96M60 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FAM227BQ96M60 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FAM227BQ96M60 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FAM227BQ96M60 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FAM227BQ96M60 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FAM227BQ96M60 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FAM227BQ96M60 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FAM227BQ96M60 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM227BQ96M60 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM227BQ96M60 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM227BQ96M60 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM227BQ96M60 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM227BQ96M60 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM227BQ96M60 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM227BQ96M60 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM227BQ96M60 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM227BQ96M60 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM227BQ96M60 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM227BQ96M60 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM227BQ96M60 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM227BQ96M60 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM227BQ96M60 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM227BQ96M60 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FAM227BQ96M60 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FAM227BQ96M60 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FAM227BQ96M60 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
FAM227BQ96M60 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FAM227BQ96M60 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FAM227BQ96M60 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FAM227BQ96M60 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FAM227BQ96M60 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FAM227BQ96M60 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FAM227BQ96M60 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FAM227BQ96M60 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FAM227BQ96M60 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FAM227BQ96M60 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FAM227BQ96M60 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FAM227BQ96M60 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FAM227BQ96M60 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FAM227BQ96M60 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FAM227BQ96M60 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FAM227BQ96M60 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FAM227BQ96M60 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FAM227BQ96M60 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM227BQ96M60 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM227BQ96M60 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM227BQ96M60 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM227BQ96M60 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM227BQ96M60 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM227BQ96M60 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM227BQ96M60 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM227BQ96M60 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM227BQ96M60 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM227BQ96M60 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM227BQ96M60 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM227BQ96M60 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FAM227BQ96M60 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAM227BQ96M60 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAM227BQ96M60 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAM227BQ96M60 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAM227BQ96M60 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAM227BQ96M60 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAM227BQ96M60 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAM227BQ96M60 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAM227BQ96M60 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAM227BQ96M60 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAM227BQ96M60 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAM227BQ96M60 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FAM227BQ96M60 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM227BQ96M60 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM227BQ96M60 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM227BQ96M60 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FAM227BQ96M60 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms