Protein–RNA interactions for Protein: Q96L96

ALPK3, Alpha-protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK3Q96L96 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALPK3Q96L96 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALPK3Q96L96 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALPK3Q96L96 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALPK3Q96L96 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALPK3Q96L96 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALPK3Q96L96 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALPK3Q96L96 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALPK3Q96L96 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALPK3Q96L96 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALPK3Q96L96 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALPK3Q96L96 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALPK3Q96L96 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALPK3Q96L96 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALPK3Q96L96 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ALPK3Q96L96 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALPK3Q96L96 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALPK3Q96L96 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALPK3Q96L96 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALPK3Q96L96 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALPK3Q96L96 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALPK3Q96L96 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALPK3Q96L96 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALPK3Q96L96 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALPK3Q96L96 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALPK3Q96L96 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ALPK3Q96L96 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALPK3Q96L96 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALPK3Q96L96 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALPK3Q96L96 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ALPK3Q96L96 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALPK3Q96L96 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALPK3Q96L96 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALPK3Q96L96 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALPK3Q96L96 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ALPK3Q96L96 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ALPK3Q96L96 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ALPK3Q96L96 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ALPK3Q96L96 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ALPK3Q96L96 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ALPK3Q96L96 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ALPK3Q96L96 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ALPK3Q96L96 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ALPK3Q96L96 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ALPK3Q96L96 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ALPK3Q96L96 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ALPK3Q96L96 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ALPK3Q96L96 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ALPK3Q96L96 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ALPK3Q96L96 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ALPK3Q96L96 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ALPK3Q96L96 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ALPK3Q96L96 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ALPK3Q96L96 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ALPK3Q96L96 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ALPK3Q96L96 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ALPK3Q96L96 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ALPK3Q96L96 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ALPK3Q96L96 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ALPK3Q96L96 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ALPK3Q96L96 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ALPK3Q96L96 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ALPK3Q96L96 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ALPK3Q96L96 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ALPK3Q96L96 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ALPK3Q96L96 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ALPK3Q96L96 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ALPK3Q96L96 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ALPK3Q96L96 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ALPK3Q96L96 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ALPK3Q96L96 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ALPK3Q96L96 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ALPK3Q96L96 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ALPK3Q96L96 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ALPK3Q96L96 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ALPK3Q96L96 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ALPK3Q96L96 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ALPK3Q96L96 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ALPK3Q96L96 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ALPK3Q96L96 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ALPK3Q96L96 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ALPK3Q96L96 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ALPK3Q96L96 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
ALPK3Q96L96 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ALPK3Q96L96 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ALPK3Q96L96 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ALPK3Q96L96 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ALPK3Q96L96 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ALPK3Q96L96 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ALPK3Q96L96 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ALPK3Q96L96 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ALPK3Q96L96 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ALPK3Q96L96 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ALPK3Q96L96 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ALPK3Q96L96 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ALPK3Q96L96 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ALPK3Q96L96 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ALPK3Q96L96 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ALPK3Q96L96 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ALPK3Q96L96 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms