Protein–RNA interactions for Protein: Q96L08

SUSD3, Sushi domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD3Q96L08 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SUSD3Q96L08 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SUSD3Q96L08 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SUSD3Q96L08 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SUSD3Q96L08 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SUSD3Q96L08 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SUSD3Q96L08 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SUSD3Q96L08 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SUSD3Q96L08 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SUSD3Q96L08 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SUSD3Q96L08 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SUSD3Q96L08 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SUSD3Q96L08 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SUSD3Q96L08 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SUSD3Q96L08 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SUSD3Q96L08 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SUSD3Q96L08 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SUSD3Q96L08 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SUSD3Q96L08 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SUSD3Q96L08 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SUSD3Q96L08 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SUSD3Q96L08 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SUSD3Q96L08 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SUSD3Q96L08 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SUSD3Q96L08 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SUSD3Q96L08 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SUSD3Q96L08 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SUSD3Q96L08 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SUSD3Q96L08 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SUSD3Q96L08 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SUSD3Q96L08 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SUSD3Q96L08 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SUSD3Q96L08 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SUSD3Q96L08 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SUSD3Q96L08 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SUSD3Q96L08 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SUSD3Q96L08 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SUSD3Q96L08 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SUSD3Q96L08 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SUSD3Q96L08 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SUSD3Q96L08 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SUSD3Q96L08 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SUSD3Q96L08 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SUSD3Q96L08 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SUSD3Q96L08 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SUSD3Q96L08 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SUSD3Q96L08 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SUSD3Q96L08 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SUSD3Q96L08 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SUSD3Q96L08 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SUSD3Q96L08 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SUSD3Q96L08 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SUSD3Q96L08 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SUSD3Q96L08 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SUSD3Q96L08 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SUSD3Q96L08 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SUSD3Q96L08 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SUSD3Q96L08 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SUSD3Q96L08 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SUSD3Q96L08 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SUSD3Q96L08 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SUSD3Q96L08 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SUSD3Q96L08 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SUSD3Q96L08 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SUSD3Q96L08 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SUSD3Q96L08 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SUSD3Q96L08 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SUSD3Q96L08 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SUSD3Q96L08 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SUSD3Q96L08 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SUSD3Q96L08 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SUSD3Q96L08 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SUSD3Q96L08 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SUSD3Q96L08 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SUSD3Q96L08 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SUSD3Q96L08 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SUSD3Q96L08 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SUSD3Q96L08 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SUSD3Q96L08 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SUSD3Q96L08 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SUSD3Q96L08 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SUSD3Q96L08 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SUSD3Q96L08 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SUSD3Q96L08 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SUSD3Q96L08 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SUSD3Q96L08 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SUSD3Q96L08 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SUSD3Q96L08 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SUSD3Q96L08 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SUSD3Q96L08 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SUSD3Q96L08 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SUSD3Q96L08 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SUSD3Q96L08 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SUSD3Q96L08 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SUSD3Q96L08 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SUSD3Q96L08 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SUSD3Q96L08 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SUSD3Q96L08 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SUSD3Q96L08 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SUSD3Q96L08 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms