Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN7

RPGRIP1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPGRIP1Q96KN7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RPGRIP1Q96KN7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPGRIP1Q96KN7 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RPGRIP1Q96KN7 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPGRIP1Q96KN7 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPGRIP1Q96KN7 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPGRIP1Q96KN7 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPGRIP1Q96KN7 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPGRIP1Q96KN7 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPGRIP1Q96KN7 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPGRIP1Q96KN7 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPGRIP1Q96KN7 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPGRIP1Q96KN7 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPGRIP1Q96KN7 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPGRIP1Q96KN7 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPGRIP1Q96KN7 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPGRIP1Q96KN7 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPGRIP1Q96KN7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RPGRIP1Q96KN7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPGRIP1Q96KN7 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPGRIP1Q96KN7 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPGRIP1Q96KN7 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPGRIP1Q96KN7 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPGRIP1Q96KN7 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RPGRIP1Q96KN7 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RPGRIP1Q96KN7 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RPGRIP1Q96KN7 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPGRIP1Q96KN7 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPGRIP1Q96KN7 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPGRIP1Q96KN7 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPGRIP1Q96KN7 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPGRIP1Q96KN7 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPGRIP1Q96KN7 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPGRIP1Q96KN7 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPGRIP1Q96KN7 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPGRIP1Q96KN7 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPGRIP1Q96KN7 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPGRIP1Q96KN7 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPGRIP1Q96KN7 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPGRIP1Q96KN7 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPGRIP1Q96KN7 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPGRIP1Q96KN7 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPGRIP1Q96KN7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPGRIP1Q96KN7 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPGRIP1Q96KN7 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPGRIP1Q96KN7 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPGRIP1Q96KN7 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPGRIP1Q96KN7 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPGRIP1Q96KN7 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPGRIP1Q96KN7 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPGRIP1Q96KN7 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RPGRIP1Q96KN7 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPGRIP1Q96KN7 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPGRIP1Q96KN7 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPGRIP1Q96KN7 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPGRIP1Q96KN7 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPGRIP1Q96KN7 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPGRIP1Q96KN7 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPGRIP1Q96KN7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPGRIP1Q96KN7 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPGRIP1Q96KN7 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPGRIP1Q96KN7 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPGRIP1Q96KN7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPGRIP1Q96KN7 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPGRIP1Q96KN7 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPGRIP1Q96KN7 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPGRIP1Q96KN7 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPGRIP1Q96KN7 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPGRIP1Q96KN7 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPGRIP1Q96KN7 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPGRIP1Q96KN7 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPGRIP1Q96KN7 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPGRIP1Q96KN7 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPGRIP1Q96KN7 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPGRIP1Q96KN7 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPGRIP1Q96KN7 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPGRIP1Q96KN7 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RPGRIP1Q96KN7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPGRIP1Q96KN7 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPGRIP1Q96KN7 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPGRIP1Q96KN7 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPGRIP1Q96KN7 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RPGRIP1Q96KN7 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPGRIP1Q96KN7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPGRIP1Q96KN7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPGRIP1Q96KN7 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RPGRIP1Q96KN7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPGRIP1Q96KN7 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPGRIP1Q96KN7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPGRIP1Q96KN7 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPGRIP1Q96KN7 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPGRIP1Q96KN7 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPGRIP1Q96KN7 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPGRIP1Q96KN7 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPGRIP1Q96KN7 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPGRIP1Q96KN7 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPGRIP1Q96KN7 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPGRIP1Q96KN7 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPGRIP1Q96KN7 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RPGRIP1Q96KN7 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms