Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF2

PRAC1, Small nuclear protein PRAC1, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAC1Q96KF2 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
PRAC1Q96KF2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms