Protein–RNA interactions for Protein: Q96JJ7

TMX3, Protein disulfide-isomerase TMX3, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX3Q96JJ7 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMX3Q96JJ7 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMX3Q96JJ7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMX3Q96JJ7 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMX3Q96JJ7 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMX3Q96JJ7 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMX3Q96JJ7 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMX3Q96JJ7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMX3Q96JJ7 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMX3Q96JJ7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TMX3Q96JJ7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMX3Q96JJ7 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMX3Q96JJ7 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMX3Q96JJ7 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMX3Q96JJ7 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMX3Q96JJ7 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMX3Q96JJ7 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMX3Q96JJ7 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMX3Q96JJ7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMX3Q96JJ7 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMX3Q96JJ7 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMX3Q96JJ7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMX3Q96JJ7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMX3Q96JJ7 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TMX3Q96JJ7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMX3Q96JJ7 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMX3Q96JJ7 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMX3Q96JJ7 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMX3Q96JJ7 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMX3Q96JJ7 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMX3Q96JJ7 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMX3Q96JJ7 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMX3Q96JJ7 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMX3Q96JJ7 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMX3Q96JJ7 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMX3Q96JJ7 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMX3Q96JJ7 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMX3Q96JJ7 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMX3Q96JJ7 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMX3Q96JJ7 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMX3Q96JJ7 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMX3Q96JJ7 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMX3Q96JJ7 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMX3Q96JJ7 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMX3Q96JJ7 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMX3Q96JJ7 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMX3Q96JJ7 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMX3Q96JJ7 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMX3Q96JJ7 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMX3Q96JJ7 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMX3Q96JJ7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMX3Q96JJ7 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMX3Q96JJ7 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMX3Q96JJ7 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMX3Q96JJ7 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TMX3Q96JJ7 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMX3Q96JJ7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMX3Q96JJ7 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMX3Q96JJ7 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMX3Q96JJ7 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMX3Q96JJ7 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMX3Q96JJ7 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMX3Q96JJ7 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMX3Q96JJ7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMX3Q96JJ7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMX3Q96JJ7 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMX3Q96JJ7 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TMX3Q96JJ7 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMX3Q96JJ7 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMX3Q96JJ7 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMX3Q96JJ7 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMX3Q96JJ7 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMX3Q96JJ7 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMX3Q96JJ7 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMX3Q96JJ7 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMX3Q96JJ7 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMX3Q96JJ7 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMX3Q96JJ7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMX3Q96JJ7 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMX3Q96JJ7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMX3Q96JJ7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMX3Q96JJ7 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMX3Q96JJ7 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMX3Q96JJ7 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMX3Q96JJ7 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMX3Q96JJ7 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMX3Q96JJ7 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMX3Q96JJ7 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMX3Q96JJ7 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMX3Q96JJ7 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMX3Q96JJ7 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TMX3Q96JJ7 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMX3Q96JJ7 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMX3Q96JJ7 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMX3Q96JJ7 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMX3Q96JJ7 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMX3Q96JJ7 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMX3Q96JJ7 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMX3Q96JJ7 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMX3Q96JJ7 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms