Protein–RNA interactions for Protein: Q96JH7

VCPIP1, Deubiquitinating protein VCIP135, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPIP1Q96JH7 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
VCPIP1Q96JH7 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VCPIP1Q96JH7 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VCPIP1Q96JH7 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VCPIP1Q96JH7 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
VCPIP1Q96JH7 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VCPIP1Q96JH7 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VCPIP1Q96JH7 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VCPIP1Q96JH7 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VCPIP1Q96JH7 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VCPIP1Q96JH7 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VCPIP1Q96JH7 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VCPIP1Q96JH7 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VCPIP1Q96JH7 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VCPIP1Q96JH7 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VCPIP1Q96JH7 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VCPIP1Q96JH7 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VCPIP1Q96JH7 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VCPIP1Q96JH7 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VCPIP1Q96JH7 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VCPIP1Q96JH7 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
VCPIP1Q96JH7 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VCPIP1Q96JH7 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VCPIP1Q96JH7 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VCPIP1Q96JH7 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VCPIP1Q96JH7 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VCPIP1Q96JH7 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VCPIP1Q96JH7 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VCPIP1Q96JH7 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
VCPIP1Q96JH7 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VCPIP1Q96JH7 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VCPIP1Q96JH7 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VCPIP1Q96JH7 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VCPIP1Q96JH7 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VCPIP1Q96JH7 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VCPIP1Q96JH7 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VCPIP1Q96JH7 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VCPIP1Q96JH7 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VCPIP1Q96JH7 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VCPIP1Q96JH7 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VCPIP1Q96JH7 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VCPIP1Q96JH7 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
VCPIP1Q96JH7 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VCPIP1Q96JH7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VCPIP1Q96JH7 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VCPIP1Q96JH7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VCPIP1Q96JH7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VCPIP1Q96JH7 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VCPIP1Q96JH7 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VCPIP1Q96JH7 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VCPIP1Q96JH7 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VCPIP1Q96JH7 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VCPIP1Q96JH7 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VCPIP1Q96JH7 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VCPIP1Q96JH7 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VCPIP1Q96JH7 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VCPIP1Q96JH7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VCPIP1Q96JH7 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VCPIP1Q96JH7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VCPIP1Q96JH7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VCPIP1Q96JH7 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VCPIP1Q96JH7 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VCPIP1Q96JH7 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VCPIP1Q96JH7 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VCPIP1Q96JH7 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VCPIP1Q96JH7 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VCPIP1Q96JH7 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VCPIP1Q96JH7 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
VCPIP1Q96JH7 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VCPIP1Q96JH7 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VCPIP1Q96JH7 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VCPIP1Q96JH7 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VCPIP1Q96JH7 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VCPIP1Q96JH7 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VCPIP1Q96JH7 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
VCPIP1Q96JH7 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VCPIP1Q96JH7 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VCPIP1Q96JH7 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VCPIP1Q96JH7 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VCPIP1Q96JH7 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
VCPIP1Q96JH7 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VCPIP1Q96JH7 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VCPIP1Q96JH7 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VCPIP1Q96JH7 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VCPIP1Q96JH7 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VCPIP1Q96JH7 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VCPIP1Q96JH7 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VCPIP1Q96JH7 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VCPIP1Q96JH7 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VCPIP1Q96JH7 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VCPIP1Q96JH7 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VCPIP1Q96JH7 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VCPIP1Q96JH7 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
VCPIP1Q96JH7 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VCPIP1Q96JH7 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VCPIP1Q96JH7 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VCPIP1Q96JH7 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
VCPIP1Q96JH7 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VCPIP1Q96JH7 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
VCPIP1Q96JH7 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms